Esta es la aplicación de Linux llamada SecStAnT para ejecutarse en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como SecStAnT.jar. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada SecStAnT para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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SecStAnT para ejecutarse en Linux en línea
DESCRIPCIÓN
SecStAnT es una herramienta para la creación automática de conjuntos de datos de estructuras de Protein Data Bank (PDB) con composición estructural definida por el usuario, y para el cálculo de sus distribuciones de variables internas.SecStAnT es capaz de
1. Seleccione de conjuntos de datos de PDB de estructuras basadas en estructuras secundarias especificadas por el usuario (definidas en base a la clasificación interna de PDB o en DSSP) y / o motivos de secuencia.
2. Construya conjuntos de datos en diferentes niveles de resolución (todos los átomos, solo la columna vertebral, solo Cα, ...)
3. Evaluar distribuciones estadísticas de variables internas:
una. distribuciones de variable única (incluidas las más relevantes en la representación atomística, por ejemplo, PHI y PSI y algunas de las de la representación basada en Cα)
B. correlaciones de dos variables (incluido el mapa PHI-PSI Ramachandran y su equivalente en la representación basada en Cα)
C. correlaciones de tres variables
Interfaz de usuario
Swing de Java
Lenguaje de programación
Java
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/secstant/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
