Esta es la aplicación de Linux llamada skewer cuya última versión se puede descargar como benchmark1-arabidopsis.thaliana-scripts.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada brocheta con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
brocheta
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DESCRIPCIÓN
Este programa implementa un novedoso algoritmo de programación dinámica dedicado a la tarea de recorte de adaptadores y está especialmente diseñado para procesar secuencias de iluminación en pares de extremos.
Caracteristicas
- Detección y eliminación de secuencias de adaptadores
- Se permite la inserción y eliminación en la coincidencia de patrones
- Dirigido a lecturas de un solo extremo, extremo emparejado (PE) y par largo de pareja (LMP)
- Demultiplexación de ejecuciones de secuenciación de códigos de barras
- Soporte de subprocesos múltiples
- Recorte basado en puntajes de calidad phred
- Caracteres IUPAC para códigos de barras y adaptadores
- Soporte de entrada y salida comprimida
Audiencia
Ciencia / Investigación
Lenguaje de programación
C + +
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/skewer/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
