Esta es la aplicación de Linux llamada Splicing Prediction Pipeline cuya última versión se puede descargar como SPiP_alone_v2_1.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Splicing Prediction Pipeline con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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Canalización de predicción de empalmes
DESCRIPCIÓN
SPiP es una herramienta para predecir la alteración del empalme de la variante mediante la integración de varias herramientas de predicción en una tubería global.
/! \ para la versión de Windows, todas las puntuaciones de SPiP se calculan entre la versión 2.0 y 2.1 antes de que la corrección sea INCORRECTA, utilice la versión 2.1 corregida o una versión posterior. Para la versión de Linux, las puntuaciones de SPiP son correctas.
También puede descargar SPiP en formato zip: https://sourceforge.net/projects/splicing-prediction-pipeline/files/SPiP_alone_v2_0.zip
Para Linux (GitHub): https://github.com/raphaelleman/SPiP
Si tiene alguna pregunta, comuníquese conmigo para: [email protected] or [email protected]
v2.1 corregido (07/2021):
corrección del cálculo de la puntuación
v2.1 (06/2021):
Más estricto en "Alterar por evento complejo"
v2.0 (04/2021):
Nuevo SPiP con modelización aleatoria de bosques
cambio antiguo detallado en https://sourceforge.net/projects/splicing-prediction-pipeline/files/changeLogBeforev2.0.txt
Interfaz de usuario
Tk
Lenguaje de programación
B / R
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/splicing-prediction-pipeline/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
