Esta es la aplicación de Linux llamada SPSens cuya última versión se puede descargar como SPSensbeta.3.4.tgz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada SPSens with OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SPSens
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DESCRIPCIÓN
SPSens es un paquete de software completo escrito en C que estima las sensibilidades de los parámetros para modelos estocásticos de redes de reacciones químicas y bioquímicas utilizando simulaciones estocásticas de Monte Carlo (MC). Es posible estimar sensibilidades con respecto a los parámetros del sistema utilizando los siguientes algoritmos: métodos de diferencias finitas (monte carlo crudo, ruta de reacción común, diferencias finitas acopladas); métodos de razón de verosimilitud; y derivados pathwise regularizados.
Además, el paquete incluye algoritmos básicos de simulación estocástica. El paquete incluye varios ejemplos de redes que pueden modificarse fácilmente para otras redes.
Las implementaciones MPI en serie y en paralelo se pueden construir y llamar desde la línea de comandos. La implementación en serie del paquete también se puede llamar desde Matlab a través de la interfaz MEX con funcionalidad limitada. Admite muchas opciones especificadas por el usuario, incluido el uso de muestreo antitético que se puede utilizar en algunos casos para aumentar la eficiencia.
Público
Ciencia / Investigación, Ingeniería
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
C
Categorias
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/spsens/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.