Esta es la aplicación de Windows llamada COV2HTML cuya última versión se puede descargar como map2cov_4.4_WIN.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada COV2HTML con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
SCREENSHOTS
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COV2HTML
DESCRIPCIÓN
COV2HTML proporciona una interfaz web fácil y 'en casa' para biólogos que permite la visualización de la cobertura de la alineación NGS necesaria para el análisis. Combina dos procesos esenciales: (i) MAP2COV, una herramienta que convierte los enormes archivos de mapeo o cobertura NGS en archivos de cobertura específicos ligeros que contienen información de elementos genéticos. (ii) COV2HTML, una interfaz de visualización que permite un análisis de datos en tiempo real con criterios seleccionados. Por lo tanto, esta interfaz ofrece una visualización de los datos de cobertura de mapeo NGS (DNA-seq, RNA-seq, ChIP-seq y TSS) realizados en diferentes organismos procariotas (bacterias, virus ...) o diferentes condiciones experimentales (mutantes versus cepas de tipo salvaje o diferentes estados de crecimiento ...) facilitando los estudios.
Caracteristicas
- Visualización de cobertura de hebra de RNA-Seq: negro (hebra +), púrpura (hebra -)
- análisis de características de ncRNA
- Se admiten Zooms X e Y
- Seguridad mejorada: HTTPS por defecto
Audiencia
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Project es un sistema de interfaz de usuario (UI), Tk
Lenguaje de programación
Pitón, PHP
Entorno de base de datos
MySQL
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/cov2html/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
