Esta es la aplicación de Windows llamada MetaPhat -meta-pheno-association-tracker cuya última versión se puede descargar como plasma_lipids_decomposed.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada MetaPhat -meta-pheno-association-tracker con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
SCREENSHOTS
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MetaPhat -meta-feno-asociación-rastreador
DESCRIPCIÓN
MetaPhat es un programa de código abierto para detectar rasgos de subconjunto óptimos en asociaciones de SNP principales a partir de resultados de resumen de GWAS de múltiples biomarcadores. Los mejores rasgos se derivan de la descomposición sistemática de asociaciones multivariadas en rasgos centrales basados en BIC óptimo y valor P de modelos CCA multivariados. Los resultados de las trazas de SNP se trazan y agrupan para diseccionar y mejorar la especificidad de las asociaciones de fenotipo-genotipo de mv.
Liberado con función LD https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Inicio rápido https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Quick%20Start
Ingresos https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Inputs
Ejemplo de lípidos globales https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Installation_global_lipids
Citar: Lin et al. (2020) MetaPhat: detección y descomposición de asociaciones multivariadas a partir de estadísticas de asociación univariadas de todo el genoma. Frente. Gineta. doi: 10.
Caracteristicas
- análisis multivariado de rasgos de todo el genoma
- Selección de subconjunto de rasgos óptimos basada en el valor p y el BIC
- trazos de trazas de descomposición de rasgos
- Aglomeración de bloques de población y LD
- archivo de resumen de características del conductor y SNP principal
- grupo de lanceros de rango de rasgo snp-snp
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
