Esta es la aplicación de Windows llamada Molecular Dynamics Studio, cuya última versión se puede descargar como WindowsRelease.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Molecular Dynamics Studio con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
SCREENSHOTS
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Estudio de dinámica molecular
DESCRIPCIÓN
Esta es una colección de modificaciones de software creadas para integrar NanoEngineer-1, PACKMOL y MSI2LMP con el propósito de crear fácilmente células de dinámica molecular. NanoEngineer-1 es un software CAD molecular escrito por Nanorex y proporciona al usuario una forma fácil de crear moléculas, mientras que las modificaciones del software permiten al usuario escribir átomos utilizando múltiples campos de fuerza. PACKMOL puede generar una colección aleatoria de moléculas utilizando las plantillas de moléculas de NanoEngineer-1, proporcionando así la célula MD inicial. Las modificaciones a PACKMOL permiten que los datos del tipo de átomo pasen al software MSI2LMP. MSI2LMP crea un archivo de entrada LAMMPS basado en campos de fuerza de clase I o clase II. MSI2LMP se modificó para utilizar datos de campo de fuerza codificados numéricamente generados por NanoEngineer-1. El formato de archivo MMP se amplió e integró en las tres aplicaciones de software.http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
Caracteristicas
- Capacidad de CAD molecular a través de NanoEngineer-1
- Escriba manualmente átomos según el campo de fuerza atomista CFF91
- Cree plantillas de moléculas con NanoEngineer-1
- Genere una célula MD usando PACKMOL y múltiples plantillas de moléculas
- Genere un archivo de entrada de geometría LAMMPS usando MSI2LMP
Público
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
OpenGL, Qt
Lenguaje de programación
Fortran, Python, C ++, C
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
