bowtie2-inspect - آنلاین در ابر

برنامه:

نام

bowtie2-inspect - لفاف برای bowtie2-inspect-* index

خلاصه

پاپیون2-بازرسی [گزینه های]*

شرح

Bowtie 2 نسخه 2.2.6 توسط Ben Langmead ([ایمیل محافظت شده]، www.cs.jhu.edu/~langmea)


نام فایل bt2 منهای دنباله .1.bt2/.2.bt2

به طور پیش فرض، رکوردهای FASTA از توالی های نوکلئوتیدی نمایه شده را به صورت استاندارد چاپ می کند
بیرون با -n، فقط اسامی را چاپ می کند. با -s، فقط خلاصه ای از شاخص را چاپ می کند
پارامترها و توالی ها با -e، در صورت لزوم رنگ ها را حفظ می کند.

OPTIONS

--شاخص بزرگ
بازرسی اجباری شاخص "بزرگ"، حتی اگر یک "کوچک" وجود داشته باشد.

-a/-- در سراسر
تعداد کاراکترهای موجود در خروجی FASTA (پیش‌فرض: 60)

-n/--نام ها
چاپ نام دنباله مرجع فقط

-s/--خلاصه
چاپ خلاصه شامل نام های مرجع، طول ها، ویژگی های شاخص

-e/--bt2-ref
بازسازی مرجع از .bt2 (کند، رنگ ها را حفظ می کند)

-v/-- پرحرف
خروجی پرمخاطب (برای رفع اشکال)

-h/--کمک
چاپ شرح دقیق ابزار و گزینه های آن

--کمک این پیام استفاده را چاپ کنید

با استفاده از خدمات onworks.net از bowtie2-inspect به صورت آنلاین استفاده کنید