این دستور cmtk-glm است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
glm - مدل خطی عمومی
خلاصه
glm [گزینه‌ها] ctlfile imgfile_pattern [ctlfile imgfile_pattern ...]
شرح
مدلسازی آماری شدت پیکسل در تصاویر چندگانه با استفاده از مدل خطی عمومی
متغیرهای مستقل مدل در یکی از فایل های کنترلی بیشتر تعریف شده اند. هر یک
فایل کنترلی یک فایل متنی است که در هر متغیر مستقل یک ستون از هم جدا شده است.
خط اول فایل کنترل، نام متغیرها، یعنی برچسب هایی را که
هر متغیر را شناسایی کنید هر خط زیر حاوی یک مقدار برای هر متغیر مستقل است.
مثال:
جنسیت سن شناسنامه
01 20 0
02 30 1
هر نام فایل کنترلی با یک الگوی نام فایل دنبال می شود. در آن الگو، یک «%s»
جای نگهدارنده مکان با مقدار موجود در ستون اول هر ردیف فایل کنترلی جایگزین می شود.
رشته به دست آمده مسیر تصویر خوانده شده و مرتبط با متغیرهای مدل است
در آن خط فایل کنترلی خاص فهرست شده است.
با استفاده از مثال فایل کنترلی بالا، الگوی 'images/subject%s.nii' به گسترش می یابد
نام فایل تصویر "images/subject01.nii" و "images/subject02.nii".
می توان از چندین فایل کنترلی استفاده کرد که هر کدام الگوی فایل تصویری متفاوتی دارند.
OPTIONS
جهانی ابزار گزینه (اینها هستند به اشتراک گذاشته شده by تمام CMTK ابزار)
--کمک
لیستی از گزینه های خط فرمان اصلی را در خروجی استاندارد بنویسید.
--کمک-همه
لیست کاملی از گزینه های خط فرمان اولیه و پیشرفته را در خروجی استاندارد بنویسید.
--ویکی
فهرستی از گزینه های خط فرمان را در خروجی استاندارد در نشانه گذاری مدیاویکی بنویسید.
--مرد
منبع صفحه مرد را در نشانه گذاری 'nroff' در خروجی استاندارد بنویسید.
- نسخه
نسخه جعبه ابزار را در خروجی استاندارد بنویسید.
-- پژواک
خط فرمان فعلی را در خروجی استاندارد بنویسید.
- سطح پرمخاطب
سطح پرحرفی را تنظیم کنید
-- پرحرف, -v
سطح پرحرفی را 1 افزایش دهید (منسوخ شده؛ برای سازگاری با عقب پشتیبانی می شود).
--موضوعات
حداکثر تعداد رشته های موازی (برای رشته های POSIX و OpenMP) را تنظیم کنید.
ورودی تنظیمات
-- محصول , -c
برای صرفه جویی در فضا/زمان، تصاویر را برش دهید: x0,y0,z0,x1,y1,z2
مدل تنظیمات
-- عادی کردن, -n
نرمال کردن پارامترهای مدل واریانس داده‌های wrt.
-- Exp, -e
از مدل نمایی به جای مدل خطی استفاده کنید.
انتخاب of مستقل متغیر
-- استثناء- ثابت, -x
حذف پارامتر ثابت خودکار از مدل.
- پارامتر - نادیده گرفته شود , -i
نادیده گرفتن پارامتر با NUMBER داده شده (0..n-1). قابل تکرار است.
--select-parameter , -s
پارامتر را با NAME داده شده برای مدل انتخاب کنید. قابل تکرار است.
تولید تنظیمات
خروجی-الگو , -O
الگوی نام فایل برای خروجی
%s با نوع تصویر ("fstat"، "tstat" یا "param") جایگزین شده است.
%d با عدد متغیر مستقل جایگزین می‌شود (0 برای کل مدل)
%s با نام متغیر مستقل جایگزین می‌شود («مدل» برای کل مدل)
[پیش‌فرض: model_%s_%02d_%s.nii ]
AUTHORS
تورستن روهلفینگ، با مشارکت مایکل پی. هاسک، گرگ جفریس، کالوین آر.
مورر، دانیل بی. روساکوف، و یاروسلاو هالچنکو
از cmtk-glm به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
