fa2dna - آنلاین در ابر

برنامه:

نام

fa2dna - پایگاه داده fasta را برای استفاده با ANFO فرمت کنید

خلاصه

fa2dna [ انتخاب | پرونده ... ]

شرح

fa2dna یک یا چند فایل را با فرمت fasta می خواند و آنها را به یک پایگاه داده مناسب تبدیل می کند
برای anfo(1). فایل(های) ورودی می تواند بیش از یک دنباله داشته باشد و هر دنباله می تواند
توسط یک امتداد N به چند بخش تقسیم می شود. همه کدهای ابهام IUPAC هستند
به طور کامل پشتیبانی می شود.

OPTIONS

-V ، - برگرداندن
شماره نسخه را چاپ کنید و خارج شوید.

فایل -o، فایل - خروجی
خروجی را بنویسید پرونده.پرونده باید به پایان برسد .dna، به دلیل anfo و برخی پایین دست
ابزارها ممکن است با پسوند دیگری برخورد کنند. پیش فرض نام ژنوم با
la .dna افزونه.

-m N، --maxn N
حداکثر تعداد را تنظیم می کند Ns باید به عنوان کدهای ابهام IUPAC تفسیر شود N؛ هر
کشش طولانی تر به عنوان جداکننده رگ ها تفسیر می شود. پیش فرض 2 است.

نام -g، -نام ژنوم
نام ژنوم را روی نام. این نام در فایل خروجی ذخیره می شود و خواهد بود
استفاده شده توسط anfo برای شناسایی ژنوم منطبق در خروجی آن. ژنوم باید a
پیشوند نام فایل خروجی تا ابزارهای پایین دستی بتوانند آن را پیدا کنند. نام
باید کوتاه، اما منحصر به فرد، چیزی مانند "hg18" یا "pt2" برای انسان یا شامپانزه باشد.
ژنوم ها خوب کار می کنند

متن -d، متن توصیفی
می افزاید: متن به عنوان توضیحاتی برای ابرداده این صرفاً اطلاعاتی است.

-v، -- پرحرف
باعث می شود نشانگر پیشرفت چاپ شود.

با استفاده از خدمات onworks.net از fa2dna به صورت آنلاین استفاده کنید