این دستور gap5 است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
gap5 - برنامه مونتاژ ژنوم (بخشی از بسته staden)
خلاصه
شکاف 5 [-رو] [-maxseq ] [-maxdb ] [-skip_notes] [DATABASE_NAME.V]
شرح
Gap5 یک برنامه مونتاژ ژنوم است. این برنامه شامل تمام ابزارهای موجود می باشد
از یک برنامه اسمبلی انتظار می رود به علاوه بسیاری از ویژگی های منحصر به فرد و بسیار آسان استفاده می شود
رابط. نسخه اصلی در Bonfield، JK، Smith، KF و Staden، R شرح داده شده است. آ
برنامه جدید مونتاژ توالی DNA Nucleic Acids Res. 24, 4992-4999 (1995)
Gap5 بسیار بزرگ و قدرتمند است. همه از زیر مجموعه ای از گزینه ها استفاده می کنند و گزینه های خود را دارند
روش مورد علاقه برای دسترسی و استفاده از آنها. اگرچه تعداد زیادی از آن وجود دارد، اما کاربران هستند
تشویق می شود یک بار کل اسناد را مرور کند، فقط برای کشف آنچه هست
ممکن است، و راهی که به بهترین وجه برای کار خودشان مناسب است. حداقل، کل این
فصل مقدماتی باید خوانده شود، زیرا در دراز مدت باعث صرفه جویی در وقت می شود.
OPTIONS
-رو فقط خواندنی
-maxseq N
حداکثر طول کل توافق اولیه اولیه
-maxdb N
حداکثر تعداد اولیه contigs + خواندن
-(نه_)بررسی
(نباید) Check Database را پس از باز شدن DB اجرا کنید
-(no_)exec_notes
هنگام باز شدن پایگاه داده، یادداشت های OPEN/CLOS را اجرا نکنید
-(no_)rawdata_note
(از یادداشت RAWD به جای RAWDATA env استفاده نکنید. متغیر
-(no_)csel
پس از باز شدن db، انتخابگر contig را راه اندازی نکنید
-نمایش دادن
نمایش X برای استفاده
-bitsize N
اندازه بیت فایل aux را برای پایگاه داده های جدید مشخص می کند (32/64)
-sync استفاده از حالت همزمان برای سرور نمایش (اشکال زدایی)
-- لیست پایان استدلال
از gap5 به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید
