این دستور gdcm2vtk است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
gdcm2vtk - یک فایل پشتیبانی شده توسط VTK را به DICOM تبدیل کنید.
خلاصه
gdcm2vtk [گزینه ها] فایل-in-out-فایل
شرح
La gdcm2vtk هر فایلی که توسط VTK پشتیبانی می شود (از جمله فایل DICOM) را به عنوان ورودی می گیرد و خواهد کرد
به عنوان خروجی یک فایل DICOM تولید کنید.
پارامترهای
نام فایل ورودی فایل (DICOM یا VTK پشتیبانی می شود)
نام فایل خروجی خروجی (پشتیبانی از DICOM یا VTK)
OPTIONS
خاص گزینه های
--force-rescale force rescale.
-- فواصل نیرو - فاصله نیرو.
--palette-color هنگامی که پشتیبانی می شود یک فایل PALETTE COLOR تولید کنید.
--argb هنگامی که پشتیبانی می شود یک فایل ARGB تولید می کند.
--compress هنگامی که پشتیبانی می شود یک فایل فشرده تولید کنید.
--use-vtkdicom از vtkDICOMImageReader (به جای GDCM) استفاده کنید.
-- modality مجموعه Modality.
--پایین-چپ مجموعه پایین سمت چپ.
--shift تنظیم تغییر.
-- مقیاس مجموعه مقیاس.
فشرده سازی مجموعه فشرده (MetaIO).
-T --study-uid مطالعه UID.
-S --series-uid سری UID.
--root-uid Root UID.
فشرده سازی گزینه های
-J --jpeg فشرده سازی تصویر در jpeg.
-K --j2k فشرده سازی تصویر در j2k.
-L --jpegls فشرده سازی تصویر در jpeg-ls.
-R --rle فشرده سازی تصویر در rle (فقط بدون ضرر).
عمومی گزینه های
-h -- کمک
این متن راهنما را چاپ کنید و خارج شوید
-v -- نسخه
چاپ اطلاعات نسخه و خروج
-V -- پرحرف
حالت پرحرف (هشدار + خطا).
-W -- هشدار
حالت هشدار، اطلاعات هشدار چاپ
-E --خطا
حالت خطا، اطلاعات خطای چاپ
-D - اشکال زدایی
حالت اشکال زدایی، چاپ اطلاعات اشکال زدایی
محیط متغیر
GDCM_ROOT_UID Root UID
شرح
یک فایل پشتیبانی شده توسط VTK را به DICOM تبدیل کنید.
استفاده معمولی این است:
$ gdcm2vtk خروجی فایل ورودی.dcm
از مکانیسم داخلی کارخانه VTK برای تشخیص یک فایل (عملکرد CanRead) استفاده می کند. دیدن
فایل پشتیبانی شده از VTK در اینجا:
VTK چه فرمت های فایل تصویری را می تواند بخواند و بنویسد؟ http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ#فرمت_های_فایل_تصویری_چه_قابلیت_خواندن_و_نوشتن_VTK را دارند.3F
اگر فایل ورودی شما دارای 4 جزء باشد، کامپ چهارم (آلفا) از خروجی حذف می شود
فایل به عنوان DICOM دیگر از مؤلفه آلفا پشتیبانی نمی کند (گزینه –argb را ببینید).
برای فرمت فایل زیر دقت خاصی صورت گرفت:
1. DICOM: Cosines جهت و vtkMedicalImageInformation به خروجی ارسال می شود
2. BMP: فایل را می توان با یک جدول جستجو ذخیره کرد (به --palette-color مراجعه کنید)
3. GE Signa: vtkMedicalImageProperties به خروجی ارسال می شود
4. MINC: Cosines جهت به خروجی ارسال می شود
5. TIFF: vtkTIFFReader در حال حاضر در VTK در وضعیت بدی قرار دارد (رفتار متفاوت در VTK 5.2 و git/master). فقط در صورتی از آن استفاده کنید که بدانید در حال انجام چه کاری هستید.
تبدیل متا تصویر (mhd، mha)
خروجی فایل ورودی gdcm2vtk $.mha
این دستور فایل ورودی DICOM: inputfile را به فایل MetaImage .mha تبدیل می کند. یکسان
می رود برای فایل mhd.
تبدیل MHA/MHD
خروجی فایل ورودی gdcm2vtk $.mha
or
$ gdcm2vtk خروجی فایل ورودی.mhd
این دستور فایل ورودی DICOM: inputfile را به MetaImageData .mha/.mhd تبدیل می کند.
فایل.
تبدیل VTI
$ gdcm2vtk فایل ورودی output.vti
این دستور فایل ورودی DICOM: inputfile را به یک XML VTK ImageData .vti تبدیل می کند.
فایل.
تبدیل VTK
$ gdcm2vtk فایل ورودی output.vtk
این دستور فایل ورودی DICOM: inputfile را به یک VTK Structured قدیمی تبدیل می کند
فایل PointSets .vtk.
تبدیل DICOM
ورودی gdcm2vtk $. خروجی dcm.dcm
vtkGDCMImageReader برای خواندن در یک فایل DICOM استفاده می شود، نه پیش فرض
vtkDICOMImageReader. برای استفاده از vtkDICOMImageReader گزینه –use-vtkdicom را ببینید.
رفت و برگشت DICOM به MHD به DICOM
$ gdcm2vtk input_ybr.dcm output.mhd
$ gdcm2vtk -- modality ایالات متحده -- فرمت تصویر 7 خروجی.mhd خروجی.dcm
بازتاب بالا نحوه تبدیل DICOM را با استفاده از تفسیر فتومتریک نشان می دهد
YBR_FULL (یا حتی YBR_FULL_422 دارای تلفات است) در قالب فایل دیگری: MetaImage (mhd). از آنجا که
این فرمت فایل فضای رنگی را مدیریت نمی کند، ما باید به صراحت آن را با استفاده از آن تنظیم کنیم
گزینه خط فرمان –imageformat. گزینه خط فرمان –modality در این مورد مورد نیاز است
از آنجایی که خانواده کلاس ذخیره‌سازی تصویر ثانویه عکس‌برداری پیش‌فرض به YBR اجازه نمی‌دهد
تفسیر فتومتریک.
GDCM2VTK NOTES
نکته مهم: ساختار VTK داخلی از ورودی DICOM پر می شود و سپس
ارسال به خروجی DICOM writer. ممکن است برخی از اطلاعات در طول تبدیل از بین برود
DICOM به VTK به DICOM. این گزینه بیشتر برای تست استفاده می شود
ترکیب vtkGDCMImageReader/vtkGDCMImageWriter.
نکته مهم: هنگام تبدیل از یک فرمت با اتلاف مانند JPEG، اطلاعات مربوط به
ضرر مهم است خروجی DICOM حاوی Lossy Image مورد نیاز است
ویژگی فشرده‌سازی که نشان می‌دهد تصویر در جایی در امتداد با اتلاف فشرده شده است
خط لوله همچنین به gdcmimg (به طور کلی مدیریت بهتر JPEG) مراجعه کنید.
نکته مهم: هنگام استفاده از –use-vtkdicom، فایل خروجی DICOM همیشه به صورت نوشته می شود.
MR Image Storage زیرا این اطلاعات از خود خواننده در دسترس نیست. این اجازه می دهد
جهت گیری تصویر (بیمار) را به درستی تنظیم کنید.
با استفاده از خدمات onworks.net از gdcm2vtk به صورت آنلاین استفاده کنید
