این دستور glam2-purge است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
glam2-purge - توالی های اضافی را از یک فایل FASTA حذف می کند
خلاصه
glam2-purge پرونده نمره [گزینه های]
شرح
glam2-purge نسخه اصلاح شده اندرو نیوالد است پالایش برنامه ای که اضافی را حذف می کند
دنباله هایی از یک فایل FASTA. این به منظور جلوگیری از بسیار مشابه توصیه می شود
توالی هایی که جستجوی نقوش را تحریف می کنند. پاکسازی با DNA یا پروتئین کار می کند
دنباله می کند و یک فایل خروجی ایجاد می کند که هیچ دو دنباله ای محلی (بدون شکاف) نداشته باشند
امتیاز هم ترازی بیشتر از آستانه تعیین شده توسط کاربر. فایل خروجی نامگذاری شده است
. . امتیاز تراز بر اساس ماتریس BLOSUM62 برای پروتئین ها و بر اساس a
طرح امتیاز دهی +5/-1 برای DNA. پاکسازی همچنین می تواند برای پوشاندن تکرارهای پشت سر هم استفاده شود. از
برنامه XNU برای این منظور.
OPTIONS
-n
توالی ها DNA هستند (پیش فرض: پروتئین).
-b
از روش اکتشافی انفجار (پیشفرض برای پروتئین) استفاده کنید.
-e
از یک روش جامع (پیش فرض برای DNA) استفاده کنید.
-q
سکانس اول را در مجموعه نگه دارید.
-x
از xnu برای پوشاندن تکرارهای پشت سر هم پروتئین استفاده کنید.
با استفاده از خدمات onworks.net از glam2-purge آنلاین استفاده کنید