gmx-eneconv - آنلاین در ابر

برنامه:

نام

gmx-eneconv - تبدیل فایل های انرژی

خلاصه

gmx eneconv [-f [<.edr> [...]]] [-o [<.edr>]] [-b ] [-e ]
[-dt ] [-انحراف ] [- [بدون] زمان تنظیم] [- [نه] مرتب سازی]
[-[نه]رمد] [-scalefac ] [- [بدون] خطا]

شرح

با چندگانه فایل ها مشخص شده برای -f گزینه:

چندین فایل انرژی را به ترتیب مرتب شده به هم متصل می کند. در مورد بازه های زمانی دوگانه،
یکی در فایل بعدی استفاده می شود. با مشخص کردن -مدت زمان معینی زمان شروع از شما خواسته می شود
از هر فایل فایل های ورودی از خط فرمان گرفته می شوند، به طوری که دستور gmx
eneconv -f *.edr -o ثابت.edr باید این ترفند را انجام داد

با یک پرونده مشخص شده برای -f:

یک فایل انرژی را می خواند و دیگری را با استفاده از آن می نویسد -dt, -انحراف, -t0 و -مدت زمان معینی
گزینه ها و تبدیل به فرمت های مختلف در صورت لزوم (که با گسترش فایل مشخص شده است).

-مدت زمان معینی ابتدا اعمال می شود، سپس -dt/-انحراف و پس از آن -b و -e برای انتخاب کدام فریم ها
نوشتن.

OPTIONS

گزینه هایی برای تعیین فایل های ورودی:

-f [<.edr> [...]] (ener.edr)
فایل انرژی

گزینه هایی برای تعیین فایل های خروجی:

-o [<.edr>] (fixed.edr)
فایل انرژی

گزینه های دیگر:

-b (-1)
اولین بار برای استفاده

-e (-1)
آخرین بار استفاده

-dt (0)
فقط زمانی که t MOD dt = offset را بنویسید

-انحراف (0)
جبران زمان برای -dt انتخاب

- [بدون] زمان تنظیم (نه)
زمان شروع را به صورت تعاملی تغییر دهید

- [نه] مرتب سازی (آره)
مرتب سازی فایل های انرژی (نه فریم ها)

-[نه]رمد (نه)
داده های بلوک انرژی رایگان را حذف کنید

-scalefac (1)
جزء انرژی را در این ضریب ضرب کنید

- [بدون] خطا (آره)
از خطاهای موجود در فایل جلوگیری کنید

شناخته شده مسائل

· هنگام ترکیب مسیرها، سیگما و E^2 (ضروری برای آمار) به روز نمی شوند.
به درستی. فقط انرژی واقعی درست است. بنابراین باید آمار را در آن محاسبه کرد
یک راه دیگر.

از gmx-eneconv به صورت آنلاین با استفاده از خدمات onworks.net استفاده کنید