نام مجموعه - آنلاین در ابر

برنامه:

نام

نام مجموعه - هر مجموعه را در ستون فقرات RNA به عنوان متعلق به یکی از 53 دسته بندی کنید
انواع تعریف شده یا به صورت پرت

خلاصه

نام سوئیت پرچم ها stdout

شرح

Suitename برنامه‌ای است که از ROC RNA Ontology Consensus RNA پشتیبانی می‌کند
نامگذاری ستون فقرات و توسعه فهرست conformer.

از ورودی دو وجهی برای یک ساختار RNA خاص (معمولاً از Dangle)، Suitename
هندسه ستون فقرات RNA هر مجموعه را دسته بندی می کند (نسخه قند به قند
باقیمانده) یا به عنوان یک پرت ("!!") یا به عنوان متعلق به یکی از 53 conformer تعریف شده
سطل ها خروجی یا یک گزارش یک خطی در هر مجموعه است یا یک رشته کانفورمر خطی (مانند
در زیر تصویر اینجا نشان داده شده است) در یکی از چندین فرمت مختلف. نام سوئیت تعبیه شده است
MolProbity، ایجاد ورودی در نمودار چند معیاره برای یک مدل RNA و همچنین
فایل suitestring

OPTIONS

پرچم های خروجی: [ -گزارش || -رشته || -کینمائی ]

پیش فرض: -گزارش - باقی مانده

پرچم های ورودی: [ - باقی مانده || -سوئیت ]

پرچم ها: [ - باقی مانده [ -pointIDfields # ] ] پیش فرض#==6

OR پرچم ها: [ -سوئیت [ -فیلدهای زاویه # ] ] پیش فرض#==9

پیش فرض ها: - باقی مانده -pointIDfields 6 همانطور که توسط آویزان ساخته شده است

آویزان "آلفا، بتا، گاما، دلتا، اپسیلون، زتا" in.pdb >out.dngl

برچسب : مدل : زنجیره : تعداد : اینس : نوع : آلفا : بتا : گاما : دلتا :
اپسیلون: زتا

-سوئیت رکوردهای نقطه ای را از یک kinemage {pointID} 7 یا 9 زاویه میدان {ptID} فرض می کند
[چی] دلتام اپسیلون زتا آلفا بتا گاما دلتا [چی]

توجه داشته باشید که سایر خطوط kinemage باید حذف شوند.

-تتاتا kinemage به جای chi-1,chi، تتا، اتا را برچسب گذاری می کند

به ترفند آویزان برای ساخت سوئیت های تتا،...،تا به طور مستقیم توجه کنید

پرچم: -گزارش [ -چارت سازمانی ] مجموعه ها به ترتیب ورودی، خلاصه مجموعه در پایان

( -چارت سازمانی : هیچ خلاصه ای در پایان وجود ندارد، برای چندچارتی MolProbity)

پرچم: -رشته 3 کاراکتر در هر رشته مجموعه به ترتیب ورودی

20 در هر خط، ptID n*20 در انتهای خط

پرچم: -دنیوی فقط نام مجموعه، بدون کاراکتر دنباله پایه

پرچم: -یک خط رشته تمام یک خط، بدون شناسه نقطه

پرچم: -همپوشانی 20 در هر خط: 10 در هر خط، 10 جدید در هر خط همپوشانی دارند

پرچم: -کینمائی کینمایشی از خوشه های گروه بندی شده بر اساس pucker،pucker ...

گروه {delta,delta},subgroup {gamma},list {cluster name} به تعیین شده اختصاص می دهد
خوشه های wannabe، پیش فرض: wannabe

پرچم: -nownabe تا آنها را واگذار نکنیم

[ قدرت #.#] پیش فرض# 3.00 محاسبه فاصله چند بعدی

[ -تست ] مرکزهای خوشه، نیم پهنا،... را به stderr

نسخه میانگین های خوشه ای: 070506

نسخه نیم عرض خوشه: 070328

نسخه محدودیت محورها: 070326

سوئیت نام توجه نکردن به زنجیر ...

با استفاده از خدمات onworks.net از Suename به صورت آنلاین استفاده کنید