این برنامه لینوکس به نام CpDB است که آخرین نسخه آن را می توان با نام CpDB.20150623.static.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام CpDB را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
CpDB
Ad
شرح
این نرم افزار به ما اجازه می دهد تا یک پایگاه داده رابطه ای در Postgres ایجاد کنیم تا ژنوم های کامل باکتری را میزبانی کنیم. علاوه بر پایگاه داده، ابزارهای نرم افزاری مانند تجزیه کننده برای تبدیل فایل های EMBL یا GBK به طرح واره رابطه ای CpDB نیز وجود دارد. هنگامی که در CpDB قرار گرفت، می توان گزارش های نامحدودی را از ژنوم باکتری با استفاده از SQL استخراج کرد. این نرم افزار بخشی از Ph.D. در بیوانفورماتیک از اندرسون سانتوس و تحت پروژه پانژنوم Corynebacterium pseudotuberculosis (Cp) توسعه یافته است. پانژنوم Cp 15 سویه باکتری سپرده شده در پایگاه داده GenBank را بین سال های 2009 تا 2012 به جامعه علمی تحویل داد. پایان نامه کامل به زبان پرتغالی-br نوشته شده است. یک فصل کتاب به زبان انگلیسی که چرا و چه چیزی برای این نرم افزار توضیح می دهد از آدرس زیر موجود است: http://www.intechopen.com/articles/show/title/whole-genome-annotation-in-silico-analysis. CpDB همچنین ستون فقرات ابزار Pannotator بود: http://pannotator.facom.ufu.br
لذت ببرید
مخاطبان
علم/تحقیق
زبان برنامه نویسی
C، PL/SQL
محیط پایگاه داده
PostgreSQL (pgsql)
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/cpdb/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
