این برنامه لینوکس به نام FASTQSim است که آخرین نسخه آن را می توان با نام FASTQsim_v2.0.tgz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن با نام FASTQSim را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
FASTQSim
Ad
شرح
FASTQSim ابزاری است که قابلیت‌های دوگانه خصوصی‌سازی مجموعه داده‌های توالی نسل بعدی و تولید داده‌های متاژنومی را فراهم می‌کند.
FASTQSim مستقل از پلتفرم توالی یابی می کند و توزیع طول خواندن، امتیازهای کیفیت، نرخ indel، نرخ جهش تک نقطه ای، اندازه ایندل و آمارهای مشابه را برای هر توالی محاسبه می کند.
سکو. برای ایجاد مجموعه داده های آموزشی یا آزمایشی، FASTQSim این توانایی را دارد که توالی های هدف را به خواندن های سیلیکو با تطبیق تبدیل کند.
پروفایل های خطا
FASTQsim به کاربر این امکان را می دهد که مجموعه داده های خوانده شده فردی را شبیه سازی کند که می تواند به عنوان سناریوهای تست استاندارد شده برای برنامه ریزی پروژه های توالی یابی یا برای محک زدن نرم افزار متاژنومیک استفاده شود. در این راستا، در مجموعه داده‌های سیلیکونی که با ابزار FASTQsim تولید می‌شوند، چندین مزیت نسبت به مجموعه داده‌های طبیعی دارند: آنها مستقل از پلتفرم توالی‌بندی هستند، به خوبی مشخص می‌شوند و تولید آنها هزینه کمتری دارد.
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/fastqsim/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
