این برنامه لینوکس با نام GenOO-HTS برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین است که آخرین نسخه آن را می توان با نام genoo-code-2013_04_18.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه به نام GenOO-HTS را به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا به صورت آنلاین با OnWorks در لینوکس اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
عکس ها
Ad
GenOO-HTS برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین
شرح
GenOO-HTS [jee-noo] یک منبع باز است. چارچوب پرل شی گرا که به طور خاص برای طراحی ابزارهای تحلیل توالی با توان بالا (HTS) توسعه یافته است. هدف اصلی GenOO-HTS این است که تجزیه و تحلیل های ساده HTS را آسان و تجزیه و تحلیل های پیچیده را ممکن کند. GenOO-HTS موجودیتهای بیولوژیکی را در اشیاء پرل مدلسازی میکند و ویژگیها و روشهای مرتبطی را ارائه میدهد که امکان دستکاری دادههای توالییابی با توان بالا را فراهم میکند. استفاده از GenOO-HTS به عنوان یک ماژول توسعه اصلی، سربار و پیچیدگی مدیریت داده ها و موجودیت های بیولوژیکی را کاهش می دهد. GenOO-HTS به گونه ای طراحی شده است که انعطاف پذیر باشد، به راحتی قابل گسترش با ساختار مدولار و حداقل نیاز برای ابزارها و کتابخانه های خارجی باشد.امکانات
- سازماندهی موجودات بیولوژیکی به عنوان اشیاء پرل (مناطق ژنومی، ژن ها، رونوشت ها، اینترون ها/اگزون ها و غیره)
- سازماندهی موجودیتهای ترتیبدهی بهعنوان اشیاء/ویژگیهای پرل (خواندن توالی، ترازها، و غیره)
- آسان کردن ورودی/خروجی از فرمتهای فایل پرکاربرد (SAM، BED، FASTA، FASTQ)
- سازگار و به راحتی قابل تمدید باشد
مخاطبان
علم/تحقیق، توسعه دهندگان
زبان برنامه نویسی
پرل
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/genoo/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.