GenOO-HTS برای اجرا در لینوکس دانلود آنلاین برای لینوکس

این برنامه لینوکس با نام GenOO-HTS برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین است که آخرین نسخه آن را می توان با نام genoo-code-2013_04_18.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.

عکس ها

GenOO-HTS برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین

شرح

GenOO-HTS [jee-noo] یک منبع باز است. چارچوب پرل شی گرا که به طور خاص برای طراحی ابزارهای تحلیل توالی با توان بالا (HTS) توسعه یافته است. هدف اصلی GenOO-HTS این است که تجزیه و تحلیل های ساده HTS را آسان و تجزیه و تحلیل های پیچیده را ممکن کند. GenOO-HTS موجودیت‌های بیولوژیکی را در اشیاء پرل مدل‌سازی می‌کند و ویژگی‌ها و روش‌های مرتبطی را ارائه می‌دهد که امکان دستکاری داده‌های توالی‌یابی با توان بالا را فراهم می‌کند. استفاده از GenOO-HTS به عنوان یک ماژول توسعه اصلی، سربار و پیچیدگی مدیریت داده ها و موجودیت های بیولوژیکی را کاهش می دهد. GenOO-HTS به گونه ای طراحی شده است که انعطاف پذیر باشد، به راحتی قابل گسترش با ساختار مدولار و حداقل نیاز برای ابزارها و کتابخانه های خارجی باشد.

امکانات

• سازماندهی موجودات بیولوژیکی به عنوان اشیاء پرل (مناطق ژنومی، ژن ها، رونوشت ها، اینترون ها/اگزون ها و غیره)
• سازمان‌دهی موجودیت‌های ترتیب‌دهی به‌عنوان اشیاء/ویژگی‌های پرل (خواندن توالی، ترازها، و غیره)
• آسان کردن ورودی/خروجی از فرمت‌های فایل پرکاربرد (SAM، BED، FASTA، FASTQ)
• سازگار و به راحتی قابل تمدید باشد

مخاطبان

علم/تحقیق، توسعه دهندگان

زبان برنامه نویسی

پرل

این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/genoo/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.