این برنامه لینوکس با نام Just_Preprocess_My_Reads است که آخرین نسخه آن را می توان با نام justpreprocessmyreads_Aug2015c.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام Just_Preprocess_My_Reads را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
Just_Preprocess_My_Reads
Ad
شرح
rRNA، آلاینده‌ها، برش‌های استاندارد و غیره را شناسایی می‌کند. جفت‌های خواندنی را حفظ می‌کند. ساخته شده برای آتش و فراموش کردن پروژه های توان عملیاتی بالا (ترابایت داده).
از pbzip2، bowtie2، fastx_toolkit، samtools، fastqc، Trimmomatic (اختیاری) استفاده می کند.
امکانات
- پیش پردازش illumina
- بررسی آلودگی
مخاطبان
علم/تحقیق
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/justpreprocessmyreads/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
