این برنامه لینوکس به نام lr2rmats برای اجرای آنلاین در لینوکس است که آخرین نسخه آن را می توان با نام lr2rmats-v0.1-alpha.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام lr2rmats را به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا در لینوکس بصورت آنلاین با OnWorks به صورت رایگان اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
عکس ها
Ad
lr2rmats برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین
شرح
lr2rmats یک خط لوله سبک وزن مبتنی بر Snakemake است که برای استفاده از داده های RNA-seq نسل سوم و نسل دوم کوتاه خوانده شده برای تولید یک فایل حاشیه نویسی ژنی پیشرفته طراحی شده است. فایل حاشیه نویسی جدید تولید شده را می توان برای تجزیه و تحلیل جایگزینی متفاوت به rMATS ارائه کرد.اطلاعات بیشتر را می توانید در اینجا پیدا کنید https://sourceforge.net/p/lr2rmats/wiki/Home/
امکانات
- طولانی خوانده شود
- RNA-seq
- تقسیم جایگزین
- علوم زیستی اقیانوس آرام
- فناوری های نانو حفره آکسفورد
مخاطبان
علم/تحقیق
رابط کاربری
خط فرمان
زبان برنامه نویسی
یونیکس شل، پایتون، سی
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/lr2rmats/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
