این برنامه لینوکس با نام Musket - اصلاح کننده خطای خواندن کوتاه است که آخرین نسخه آن را می توان با نام musket-1.1.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام Musket - اصلاح کننده خطای خواندن کوتاه را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
Musket - تصحیح کننده خطای خواندن کوتاه
Ad
شرح
Musket یک تصحیح کننده چند مرحله ای مبتنی بر k-mer برای داده های خواندن کوتاه Illumina است. این تصحیح کننده از رویکرد طیف k-mer استفاده می کند و سه تکنیک اصلاح را در یک گردش کار چند مرحله ای معرفی می کند. نتایج ارزیابی عملکرد ما، از نظر کیفیت تصحیح و معیارهای مونتاژ ژنوم جدید، نشان می‌دهد که Musket به طور مداوم یکی از بهترین اصلاح‌کننده‌های مبتنی بر خطای جایگزینی است. علاوه بر این، Musket با استفاده از مدل master-slave چند رشته ای است و مقیاس پذیری موازی برتر را در مقایسه با سایر اصلاح کننده های ارزیابی شده و همچنین زمان اجرای کلی بسیار رقابتی را نشان می دهد.
مخاطبان
صنعت بهداشت و درمان، علم/تحقیق
رابط کاربری
کنسول/ترمینال، خط فرمان
زبان برنامه نویسی
++C
دسته بندی ها
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/musket/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
