این برنامه لینوکس با نام PolyCTLDesigner برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان dist_PolyCTLDesigner.0.3.a.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام PolyCTLDesigner را به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا به صورت آنلاین با OnWorks در لینوکس اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
PolyCTLDesigner برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین
Ad
شرح
با توجه به پپتیدها (اپی توپ های سلول T)، PolyCTLDesigner توالی های کناری را برای بهینه سازی اتصال به TAP انتخاب می کند و الیگوپپتیدهای حاصل را به یک پلی اپی توپ می پیوندد، به گونه ای که آزادسازی موثر اپی توپ های بالقوه توسط پردازش پروتئازومی و/یا ایمونوپروتئازومی و به حداقل رساندن تعداد epitopi را به حداقل می رساند. برای ساخت پلی اپی توپ، PolyCTLDesigner از الگوهای اسید آمینه شناخته شده برش پروتئازوم و ویژگی اتصال به TAP استفاده می کند. PolyCTLDesigner همچنین قادر به انتخاب پپتیدهای آنتی ژنی است که مجموعه HLA انتخاب شده را با نرخ افزونگی مطلوب پوشش می دهند. با توجه به توالی آنتی ژن PolyCTLDesigner همچنین قادر به انتخاب اپی توپ های T-helper است. برای پیش بینی اپی توپ های سلول T از TEpredict استفاده می کند.مخاطبان
علم/تحقیق
زبان برنامه نویسی
پــایتــون
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/polyctldesigner/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.