این برنامه لینوکس به نام Pontos برای اجرای آنلاین در لینوکس است که آخرین نسخه آن را می توان با نام Pontos-3.0.jar دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه به نام Pontos را به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا به صورت رایگان در لینوکس با OnWorks اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
عکس ها
Ad
Pontos به صورت آنلاین در لینوکس اجرا می شود
شرح
Pontos یک برنامه گرافیکی جاوا با کاربری آسان برای محاسبه فاصله (یا شباهت) اصلاح نشده ماتریس از ترازهای توالی DNA در قالب PHYLIP است. همچنین ترازهای "تفاوت" را با ترازهای معمولی ایجاد می کند (و بالعکس).می تواند شکاف ها و ابهامات را به طرق مختلف مدیریت کند.
شکاف ها می توانند:
- همه استفاده می شود
- همه نادیده گرفته شدند.
- فقط در انتهای دنباله ها، به صورت زوجی نادیده گرفته می شود.
- فقط در انتها نادیده گرفته می شود، اما اکنون به صورت سراسری (در واقع کل تراز را به دورترین دنباله ها از انتها کوتاه می کند).
ابهامات (چیزهایی مانند R، Y، N، W و غیره در یک توالی DNA) را می توان به صورت زیر بررسی کرد:
- ابهامات را مثل همیشه متفاوت در نظر بگیرید.
- ابهام را تا حدی متفاوت در نظر بگیرید (مثلاً R 0.5 با A یا G متفاوت است).
- نادیده گرفتن ابهامات در هر مقایسه زوجی؛
- حذف تمام ستون ها، به صورت سراسری، که هر گونه ابهامی را نشان می دهند.
Pontos در لینوکس نوشته شده است، اما باید در هر سیستمی که جاوا کار می کند اجرا شود. Pontos تحت مجوز GPL نسخه 3 است.
مخاطبان
علم/تحقیق، کاربران نهایی/رومیزی
رابط کاربری
جاوا Swing
زبان برنامه نویسی
جاوه
این برنامه ای است که می تواند از https://sourceforge.net/projects/pontos/ نیز دریافت شود. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
