این برنامه لینوکس با نام RGAAT برای اجرا در لینوکس به صورت آنلاین است که آخرین نسخه آن را می توان با نام RGAAT.tar.gz دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه با نام RGAAT را به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا به صورت آنلاین و رایگان در لینوکس با OnWorks اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. OnWorks Linux آنلاین یا شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MACOS را از این وب سایت راه اندازی کنید.
- 5. از سیستم عامل لینوکس OnWorks که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. اپلیکیشن را دانلود کرده، نصب و اجرا کنید.
عکس ها
Ad
RGAAT به صورت آنلاین در لینوکس اجرا می شود
شرح
این برنامه می‌تواند ژنوم را برای ژنوم جدید و ارتقای ژنوم شناخته‌شده با استفاده از فایل هم‌ترازی توالی (فرمت SAM یا BAM)، فایل متغیر توالی (فرمت VCF یا جدول پنج ستونی (با جدا کردن برگه‌ها، شامل کروموزوم، موقعیت، شناسه، مرجع جمع‌آوری و یا حاشیه‌نویسی کند. آلل و آلل جایگزین)) یا فایل توالی ژنوم جدید (فرمت FASTA) بر اساس فایل توالی ژنوم مرجع (فرمت FASTA) و فایل حاشیه نویسی (فرمت TBL، GTF، GFF، GFF3 یا BED).امکانات
- شناسایی تنوع توالی
- ساخت توالی اجماع ژنوم
- اصلاح ژنوم
- مقایسه ژنوم
- حاشیه نویسی ژنوم
- تبدیل مختصات ژنومی ساختمان بین نسخه‌های مختلف مونتاژ ژنوم
مخاطبان
علم/تحقیق
زبان برنامه نویسی
پرل
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/rgaat/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
