این برنامه ویندوز به نام ChIP-RNA-seqPRO برای اجرا در ویندوز به صورت آنلاین از طریق لینوکس آنلاین است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان cloudclientID.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این برنامه به نام ChIP-RNA-seqPRO را به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید تا به صورت آنلاین و رایگان در ویندوز از طریق لینوکس به صورت آنلاین با OnWorks اجرا شود.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. هر شبیه ساز آنلاین OS OnWorks را از این وب سایت راه اندازی کنید، اما شبیه ساز آنلاین ویندوز بهتر است.
- 5. از OnWorks Windows OS که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. برنامه را دانلود و نصب کنید.
- 7. Wine را از مخازن نرم افزار توزیع لینوکس خود دانلود کنید. پس از نصب، می توانید روی برنامه دوبار کلیک کنید تا آنها را با Wine اجرا کنید. همچنین می توانید PlayOnLinux را امتحان کنید، یک رابط کاربری فانتزی بر روی Wine که به شما کمک می کند برنامه ها و بازی های محبوب ویندوز را نصب کنید.
Wine راهی برای اجرای نرم افزار ویندوز بر روی لینوکس است، اما بدون نیاز به ویندوز. Wine یک لایه سازگار با ویندوز منبع باز است که می تواند برنامه های ویندوز را مستقیماً بر روی هر دسکتاپ لینوکس اجرا کند. اساساً، Wine در تلاش است تا به اندازه کافی از ویندوز را از ابتدا مجدداً پیاده سازی کند تا بتواند همه آن برنامه های ویندوز را بدون نیاز به ویندوز اجرا کند.
عکس ها
Ad
ChIP-RNA-seqPRO برای اجرا در ویندوز به صورت آنلاین از طریق لینوکس به صورت آنلاین
شرح
ChIP-RNA-seqPRO: یک استراتژی برای شناسایی نواحی تنظیم‌زدایی اپی ژنتیکی مرتبط با پیوند نابجای رونوشت و سایت‌های ویرایش RNA. اسکریپت های پایتون قابل اجرا همراه با کتابخانه های حاشیه نویسی سفارشی، ورودی داده های نمایشی و راهنمای README بسته بندی شده اند.9/26: نسخه 1.1 MAIN_IV برای خطایابی خطای ایجاد شده توسط پانداهای پایتون که دیگر از «زیر مجموعه» پشتیبانی نمی‌کنند، به‌روزرسانی شد.
این کد دیگر به‌طور فعال در اینجا نگهداری/به‌روزرسانی نمی‌شود. یک منبع مبتنی بر ابر برای تجزیه و تحلیل مقایسه ای مجموعه داده های اپی ژنتیک، تغییرات توالی و بیان اکنون در دسترس است. لطفاً از پروژه کلودومیکس برای منابع مبتنی بر ابر بازدید کنید: https://sourceforge.net/projects/cloudomics-for-aws/
امکانات
- ابزاری برای تجزیه و تحلیل مقایسه ای طیف گسترده ای از مجموعه داده های نمونه جفتی اپی ژنومیک (ChIPseq، MBDseq، و غیره) و توالی یابی مبتنی بر RNA
- اگر از این ابزار یا هر یک از کتابخانه های حاشیه نویسی استفاده می کنید، لطفاً مرجع زیر را وارد کنید: Champion M., Hlady R., Yan H., Evans J., Nie J., Lee J., Bogenberger J., Nandakumar K., Davila جی.، مور آر.، نایر آ.، اوبراین دی.، ژو ی.، کورتوم ک.، اردوگ تی.، ژانگ زی.، جوزف آر.، کوچر جی.، یوناش ای.، رابرتسون ک.، تیبز R. and H. Ho T. (2015). استراتژی‌های بیوانفورماتیک برای شناسایی مناطق تنظیم‌زدایی اپی ژنتیک مرتبط با پیوند نابجا رونوشت و ویرایش RNA. در مجموعه مقالات کنفرانس بین المللی مدل ها، روش ها و الگوریتم های بیوانفورماتیک، صفحات 163-170. DOI: 10.5220/0005248001630170
مخاطبان
علم/تحقیق
زبان برنامه نویسی
یونیکس شل، پایتون
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/chiprnaseqpro/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
