این برنامه ویندوز با نام Molecular Dynamics Studio است که آخرین نسخه آن را می توان با عنوان WindowsRelease.zip دانلود کرد. می توان آن را به صورت آنلاین در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks برای ایستگاه های کاری اجرا کرد.
این اپلیکیشن با نام Molecular Dynamics Studio را با OnWorks به صورت آنلاین دانلود و اجرا کنید.
برای اجرای این برنامه این دستورالعمل ها را دنبال کنید:
- 1. این برنامه را در رایانه شخصی خود دانلود کنید.
- 2. در فایل منیجر ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX نام کاربری مورد نظر خود را وارد کنید.
- 3. این برنامه را در چنین فایل منیجر آپلود کنید.
- 4. هر شبیه ساز آنلاین OS OnWorks را از این وب سایت راه اندازی کنید، اما شبیه ساز آنلاین ویندوز بهتر است.
- 5. از OnWorks Windows OS که به تازگی راه اندازی کرده اید، به مدیر فایل ما https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX با نام کاربری که می خواهید بروید.
- 6. برنامه را دانلود و نصب کنید.
- 7. Wine را از مخازن نرم افزار توزیع لینوکس خود دانلود کنید. پس از نصب، می توانید روی برنامه دوبار کلیک کنید تا آنها را با Wine اجرا کنید. همچنین می توانید PlayOnLinux را امتحان کنید، یک رابط کاربری فانتزی بر روی Wine که به شما کمک می کند برنامه ها و بازی های محبوب ویندوز را نصب کنید.
Wine راهی برای اجرای نرم افزار ویندوز بر روی لینوکس است، اما بدون نیاز به ویندوز. Wine یک لایه سازگار با ویندوز منبع باز است که می تواند برنامه های ویندوز را مستقیماً بر روی هر دسکتاپ لینوکس اجرا کند. اساساً، Wine در تلاش است تا به اندازه کافی از ویندوز را از ابتدا مجدداً پیاده سازی کند تا بتواند همه آن برنامه های ویندوز را بدون نیاز به ویندوز اجرا کند.
عکس ها
Ad
استودیو دینامیک مولکولی
شرح
این مجموعه ای از تغییرات نرم افزاری است که برای ادغام NanoEngineer-1، PACKMOL و MSI2LMP به منظور ایجاد آسان سلول های دینامیک مولکولی ایجاد شده است. NanoEngineer-1 یک نرم افزار CAD مولکولی است که توسط Nanorex نوشته شده است و راه آسانی را برای ایجاد مولکول در اختیار کاربر قرار می دهد، در حالی که تغییرات نرم افزاری به کاربر اجازه می دهد تا اتم ها را با استفاده از میدان های نیروی متعدد تایپ کند. PACKMOL می‌تواند مجموعه‌ای تصادفی از مولکول‌ها را با استفاده از قالب‌های مولکولی NanoEngineer-1 تولید کند و در نتیجه سلول MD اولیه را فراهم کند. تغییرات PACKMOL اجازه می دهد تا داده های نوع اتم به نرم افزار MSI2LMP منتقل شوند. MSI2LMP یک فایل ورودی LAMMPS بر اساس فیلدهای نیروی کلاس I یا کلاس II ایجاد می کند. MSI2LMP برای استفاده از داده های میدان نیروی کدگذاری شده عددی ایجاد شده توسط NanoEngineer-1 اصلاح شد. فرمت فایل MMP توسعه یافته و در هر سه برنامه نرم افزاری ادغام شد.http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
امکانات
- قابلیت CAD مولکولی از طریق NanoEngineer-1
- اتم ها را به صورت دستی بر اساس میدان نیروی اتمی CFF91 تایپ کنید
- با استفاده از NanoEngineer-1 الگوهای مولکولی ایجاد کنید
- یک سلول MD با استفاده از PACKMOL و الگوهای چند مولکولی تولید کنید
- با استفاده از MSI2LMP یک فایل ورودی LAMMPS Geometry ایجاد کنید
مخاطبان
علم/تحقیق
رابط کاربری
OpenGL، Qt
زبان برنامه نویسی
Fortran، Python، C++، C
این برنامه ای است که می توان آن را از https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/ نیز دریافت کرد. در OnWorks میزبانی شده است تا به آسانی از یکی از سیستم عامل های رایگان ما به صورت آنلاین اجرا شود.
