Il s'agit de la commande bowtie2-inspect qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
bowtie2-inspect - emballage pour bowtie2-inspect-* index
SYNOPSIS
nœud papillon2-inspecter [Options]*
DESCRIPTION
Bowtie 2 version 2.2.6 par Ben Langmead ([email protected], www.cs.jhu.edu/~langmea)
nom de fichier bt2 moins .1.bt2/.2.bt2 de fin
Par défaut, imprime les enregistrements FASTA des séquences nucléotidiques indexées au format standard
dehors. Avec -n, imprime juste les noms. Avec -s, imprime juste un résumé de l'index
paramètres et séquences. Avec -e, préserve les couleurs le cas échéant.
OPTIONS
--grand-index
forcer l'inspection du « grand » index, même si un « petit » est présent.
-a/--de l'autre côté
Nombre de caractères dans la sortie FASTA (par défaut : 60)
-n/--noms
Imprimer uniquement les noms de séquence de référence
-s/--sommaire
Imprimer le résumé incl. noms de référence, longueurs, propriétés d'index
-e/--bt2-réf
Reconstruire la référence à partir de .bt2 (lent, préserve les couleurs)
-v/--verbeux
Sortie détaillée (pour le débogage)
-h/--aider
imprimer une description détaillée de l'outil et de ses options
--Aidez-moi imprimer ce message d'utilisation
Utilisez bowtie2-inspect en ligne en utilisant les services onworks.net
