Il s'agit de la commande bp_nrdbp qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos nombreux postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
bp_nrdb.PLS - un script pour émuler le nrdb de Warren Gish, créer une base de données de séquences unique à partir de
un ensemble de bases de données d'entrée
SYNOPSIS
Usage:
bp_nrdb.PLS [options] fichier1 fichier2 fichier3
Utilisation alternative
bp_nrdb.PLS -p [options] fichier1 id1 fichier2 id2 fichier3 id3
DESCRIPTION
Ce script créera une base de données unique de séquences (quasi non redondantes). Les options
sont:
-o nom_fichier - le nom du fichier dans lequel la base de données est écrite (STDOUT par défaut)
-a nom de fichier - le nom de fichier auquel ajouter la base de données
-l# - longueur de séquence minimale requise
-i - ne pas vérifier les doublons
-n# - nombre maximal de descriptions à signaler par séquence
-d# - délimiteur à utiliser entre les descriptions consécutives
-p - utiliser les préfixes d'ID de base de données à partir de la ligne de commande
Utilisez bp_nrdbp en ligne à l'aide des services onworks.net
