Il s'agit de la commande cmtk-asegment_sri24 qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
asegment_sri24 - Segmentation à l'aide de l'atlas SRI24
SYNOPSIS
segment_sri24 Image de sortie TargetImage
DESCRIPTION
Enregistrez une image cible sur un canal sélectionné de l'atlas du cerveau humain SRI24, puis
reformater l'une des cartes d'étiquettes de l'atlas sur l'image cible. Remarque : il est supposé que le
l'image cible est dépouillé de son crâne, c'est-à-dire qu'elle ne contient que le cerveau.
OPTIONS
Global Boîte à outils Options (celles-ci sommes-nous a partagé la publication de by tous CMTK outils)
--Aidez-moi
Écrire la liste des options de ligne de commande de base sur la sortie standard.
--aide-à tous
Écrivez la liste complète des options de ligne de commande de base et avancées sur la sortie standard.
- Wiki
Écrire la liste des options de ligne de commande sur la sortie standard dans le balisage MediaWiki.
--homme
Écrire la source de la page de manuel dans le balisage « nroff » sur la sortie standard.
--xml
Écrivez la spécification de la syntaxe de la ligne de commande dans le balisage XML (pour l'intégration de Slicer).
--version
Écrire la version de la boîte à outils sur la sortie standard.
--écho
Écrire la ligne de commande actuelle sur la sortie standard.
--niveau détaillé
Définir le niveau de verbosité.
--verbeux, -v
Incrémentez le niveau de verbosité de 1 (obsolète ; pris en charge pour la compatibilité descendante).
--threads
Définir le nombre maximum de threads parallèles (pour les threads POSIX et OpenMP).
Entrée Options
--vite, -f
Mode rapide.
--canal-d'enregistrement
Le canal SRI24 utilisé pour l'enregistrement sur l'image cible. Valeurs prises en charge :
"spgr", "early-fse", "late-fse", "fa", où la valeur par défaut est "spgr", ou utilisez l'un des
Suivante à la suite:
--spgr
Canal structurel SPGR (pondéré en T1) [Ce is le défaut]
--début-fse
Canal d'écho de spin rapide à écho précoce (pondéré PD)
--late-fse
Canal d'écho de spin rapide à écho tardif (pondéré T2)
--FA Canal d'anisotropie fractionnaire, dérivé d'images du tenseur de diffusion
--étiquette-carte
La carte d'étiquettes SRI24 qui est reformatée selon l'image cible. Valeurs prises en charge :
"tzo116plus", "lpba40", "tissue", où la valeur par défaut est "tzo116plus", ou utilisez l'un des
ce qui suit:
--tzo116plus
Gabarit de parcellation corticale étendue basé sur la région Tzourio-Mazoyer AAL 116
modèle. [Ce is le défaut]
--lpba40
Modèle basé sur la segmentation de l'atlas probabiliste du cerveau LONI à 40 sujets.
--tissu
Segmentation tissulaire à trois compartiments SRI24 à probabilité maximale (GM, MW, LCR)
carte
AUTEURS
Torsten Rohlfing, avec les contributions de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff et Yaroslav Halchenko
Utilisez cmtk-asegment_sri24 en ligne en utilisant les services onworks.net
