Il s'agit de la commande cmtk-glm qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
glm - Modèle linéaire général
SYNOPSIS
glm [options] ctlfile imgfile_pattern [ctlfile imgfile_pattern ...]
DESCRIPTION
Modélisation statistique des intensités de pixels dans plusieurs images à l'aide d'un modèle linéaire général.
Les variables indépendantes du modèle sont définies dans un ou plusieurs fichiers de contrôle. Chaque
control file est un fichier texte avec une colonne séparée par des espaces par variable indépendante.
La première ligne du fichier de contrôle définit les noms des variables, c'est-à-dire les étiquettes qui
identifier chaque variable. Chaque ligne suivante contient une valeur par variable indépendante.
Mise en situation :
ID âge sexe
+01 (20)0
+02 (30)1
Chaque nom de fichier de contrôle est suivi d'un modèle de nom de fichier. Dans ce modèle, un seul '%s'
l'espace réservé est remplacé par la valeur trouvée dans la première colonne de chaque ligne du fichier de contrôle.
La chaîne résultante est le chemin de l'image lue et associée aux variables du modèle
répertorié sur cette ligne de fichier de contrôle particulière.
En utilisant l'exemple de fichier de contrôle ci-dessus, le modèle 'images/subject%s.nii' s'étendrait à
les noms de fichier image 'images/subject01.nii' et 'images/subject02.nii'.
Plusieurs fichiers de contrôle peuvent être utilisés, chacun avec un modèle de fichier image différent.
OPTIONS
Global Boîte à outils Options (celles-ci commun by TOUTE CMTK outils)
--Aidez-moi
Écrire la liste des options de ligne de commande de base sur la sortie standard.
--aide-à tous
Écrivez la liste complète des options de ligne de commande de base et avancées sur la sortie standard.
- Wiki
Écrire la liste des options de ligne de commande sur la sortie standard dans le balisage MediaWiki.
--homme
Écrire la source de la page de manuel dans le balisage « nroff » sur la sortie standard.
--version
Écrire la version de la boîte à outils sur la sortie standard.
--écho
Écrire la ligne de commande actuelle sur la sortie standard.
--niveau détaillé
Définir le niveau de verbosité.
--verbeux, -v
Incrémentez le niveau de verbosité de 1 (obsolète ; pris en charge pour la compatibilité descendante).
--threads
Définir le nombre maximum de threads parallèles (pour les threads POSIX et OpenMP).
Entrée Paramètres
--recadrer , -c
Pour économiser de l'espace/du temps, recadrez les images : x0,y0,z0,x1,y1,z2
Modèle Paramètres
--normaliser, -n
Normaliser les paramètres du modèle par rapport aux écarts de données.
--exp, -e
Utilisez un modèle exponentiel plutôt qu'un modèle linéaire.
Sélection of Independent Variables
--exclude-constante, -x
Exclure le paramètre constant automatique du modèle.
--ignore-paramètre , -i
Ignorer le paramètre avec le NUMÉRO donné (0..n-1). Peut être répété.
--select-paramètre , -s
Sélectionnez le paramètre avec le NOM donné pour le modèle. Peut être répété.
Sortie Paramètres
--output-motif , -O
Modèle de nom de fichier pour la sortie.
%s est remplacé par le type d'image ('fstat', 'tstat' ou 'param')
%d est remplacé par un numéro de variable indépendant (0 pour l'ensemble du modèle)
%s est remplacé par le nom de la variable indépendante (« modèle » pour le modèle entier)
[Défaut: modèle_%s_%02d_%s.nii ]
AUTEURS
Torsten Rohlfing, avec les contributions de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff et Yaroslav Halchenko
Utilisez cmtk-glm en ligne en utilisant les services onworks.net
