Il s'agit de la commande fastq_quality_filter qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
fastq_quality_filter - Filtre les séquences en fonction de la qualité
DESCRIPTION
utilisation : fastq_quality_filter [-h] [-v] [-q N] [-p N] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] Fait partie de
FASTX Toolkit 0.0.14 par A. Gordon ([email protected])
[-h] = Cet écran d'aide utile.
[-q N] = Score de qualité minimum à conserver.
[-p N] = Pourcentage minimum de bases qui doivent avoir une qualité [-q].
[-z] = Compresser la sortie avec GZIP.
[-i INFILE]
= fichier d'entrée FASTA/Q. la valeur par défaut est STDIN.
[-o OUTFILE] = fichier de sortie FASTA/Q. la valeur par défaut est STDOUT. [-v] = verbeux -
rapporter le nombre de séquences.
Si [-o] est spécifié,
le rapport sera imprimé sur STDOUT.
Si [-o] n'est pas spécifié (et la sortie va vers STDOUT), le rapport sera imprimé sur
STDERR.
Utilisez fastq_quality_filter en ligne en utilisant les services onworks.net
