Il s'agit de la commande fastx_trimmer qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
fastx_trimmer - Tondeuse FASTA/Q
DESCRIPTION
utilisation : fastx_trimmer [-h] [-f N] [-l N] [-t N] [-m MINLEN] [-z] [-v] [-i INFILE] [-o
OUTFILE] Une partie de FASTX Toolkit 0.0.14 par A. Gordon ([email protected])
[-h] = Cet écran d'aide utile.
[-f N] = Première base à garder. La valeur par défaut est 1 (=première base).
[-l N] = Dernière base à conserver. La valeur par défaut est la lecture entière.
[-t N] = Trim N nucléotides à partir de la fin de la lecture.
'-t' ne peut pas être utilisé avec '-l' et '-f'.
[-m MINLEN]
= Avec [-t], supprime les lectures plus courtes que MINLEN.
[-z] = Compresser la sortie avec GZIP.
[-i INFILE]
= fichier d'entrée FASTA/Q. la valeur par défaut est STDIN.
[-o OUTFILE] = fichier de sortie FASTA/Q. la valeur par défaut est STDOUT.
Utilisez fastx_trimmer en ligne en utilisant les services onworks.net
