Il s'agit de la commande fdnamlke qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS.
PROGRAMME:
Nom
fdnamlk - Estimation de la phylogénie des nucléotides par maximum de vraisemblance
SYNOPSIS
fdnamlk -séquence séqsetall -fichierintree arbre [-catégories entier] -taux tableau
-catégories propriétés [-poids propriétés] [-tratio flotter] [-freqsde basculer]
-fréquence de base tableau [-gamme liste] -coefficient gamma flotter -ngammacat entier
-invarcoefficient flotter -ninvarcat entier -invarfrac flotter
-nhmmccatégories entier -hmmrates tableau -hmmprobabilités tableau -adjsite booléen
-lambda flotter -mêler entier -la graine entier -mondial booléen -longueurs booléen
-fichier de sortie fichier de sortie [-truite basculer] -fichierouttree fichier de sortie [-données d'impression booléen]
[-le progrès booléen] [-empreinte d'arbre booléen] [-hypétat booléen]
fdnamlk -Aide
DESCRIPTION
fdnamlk est un programme en ligne de commande d'EMBOSS (« the European Molecular Biology Open
suite logicielle"). Il fait partie du ou des groupes de commandes "Phylogénie:Séquence moléculaire".
OPTIONS
Entrée
-séquence séqsetall
Fichier contenant un ou plusieurs alignements de séquences
-fichierintree arbre
-catégories entier
Valeur par défaut : 1
-taux tableau
-catégories propriétés
-poids propriétés
Supplémentaire
-tratio flotter
Valeur par défaut : 2.0
-freqsde basculer
Valeur par défaut : O
-fréquence de base tableau
Valeur par défaut : 0.25 0.25 0.25 0.25
-gamme liste
Valeur par défaut : taux constant
-coefficient gamma flotter
Valeur par défaut : 1
-ngammacat entier
Valeur par défaut : 1
-invarcoefficient flotter
Valeur par défaut : 1
-ninvarcat entier
Valeur par défaut : 1
-invarfrac flotter
Valeur par défaut : 0.0
-nhmmccatégories entier
Valeur par défaut : 1
-hmmrates tableau
Valeur par défaut : 1.0
-hmmprobabilités tableau
Valeur par défaut : 1.0
-adjsite booléen
Valeur par défaut : N
-lambda flotter
Valeur par défaut : 1.0
-mêler entier
-la graine entier
Valeur par défaut : 1
-mondial booléen
Valeur par défaut : N
-longueurs booléen
Valeur par défaut : N
Sortie
-fichier de sortie fichier de sortie
-truite basculer
Valeur par défaut : O
-fichierouttree fichier de sortie
-données d'impression booléen
Valeur par défaut : N
-le progrès booléen
Valeur par défaut : O
-empreinte d'arbre booléen
Valeur par défaut : O
-hypétat booléen
Valeur par défaut : N
Utilisez fdnamlke en ligne en utilisant les services onworks.net
