Il s'agit de la commande fpromlke qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
fpromlk - Phylogénie des protéines par maximum de vraisemblance
SYNOPSIS
fpromlk -séquence séqsetall -fichierintree arbre [-catégories entier] -taux tableau
-catégories propriétés [-poids propriétés] -longueurs booléen [-modèle liste]
[-gamme liste] -coefficient gamma flotter -ngammacat entier -invarcoefficient flotter
-ninvarcat entier -invarfrac flotter -nhmmccatégories entier -hmmrates tableau
-hmmprobabilités tableau -adjsite booléen -lambda flotter -mêler entier
-la graine entier -mondial booléen [-outgrno entier] -fichier de sortie fichier de sortie [-truite basculer]
-fichierouttree fichier de sortie [-données d'impression booléen] [-le progrès booléen] [-empreinte d'arbre booléen]
[-hypétat booléen]
fpromlk -Aide
DESCRIPTION
fpromlk est un programme en ligne de commande d'EMBOSS (« the European Molecular Biology Open
suite logicielle"). Il fait partie du ou des groupes de commandes "Phylogénie:Séquence moléculaire".
OPTIONS
Entrée
-séquence séqsetall
Fichier contenant un ou plusieurs alignements de séquences
-fichierintree arbre
-catégories entier
Valeur par défaut : 1
-taux tableau
-catégories propriétés
-poids propriétés
Supplémentaire
-longueurs booléen
Valeur par défaut : N
-modèle liste
Valeur par défaut : Jones-Taylor-Thornton
-gamme liste
Valeur par défaut : n
-coefficient gamma flotter
Valeur par défaut : 1
-ngammacat entier
Valeur par défaut : 1
-invarcoefficient flotter
Valeur par défaut : 1
-ninvarcat entier
Valeur par défaut : 1
-invarfrac flotter
Valeur par défaut : 0.0
-nhmmccatégories entier
Valeur par défaut : 1
-hmmrates tableau
Valeur par défaut : 1.0
-hmmprobabilités tableau
Valeur par défaut : 1.0
-adjsite booléen
Valeur par défaut : N
-lambda flotter
Valeur par défaut : 1.0
-mêler entier
-la graine entier
Valeur par défaut : 1
-mondial booléen
Valeur par défaut : N
-outgrno entier
Sortie
-fichier de sortie fichier de sortie
-truite basculer
Valeur par défaut : O
-fichierouttree fichier de sortie
-données d'impression booléen
Valeur par défaut : N
-le progrès booléen
Valeur par défaut : O
-empreinte d'arbre booléen
Valeur par défaut : O
-hypétat booléen
Valeur par défaut : N
Utilisez fpromlke en ligne en utilisant les services onworks.net
