Il s'agit de la commande hmm2fetch qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
hmm2fetch - récupère un HMM à partir d'une base de données HMM
SYNOPSIS
hmm2fetch [choix] base de données prénom
DESCRIPTION
hmm2fetch est un petit utilitaire qui récupère un HMM appelé prénom à partir d'une base de données modèle HMMER
appelé base de données. dans un nouveau format et imprime ce modèle sur une sortie standard. Par exemple,
hmm2fetch Pfam RRM récupère le modèle RRM (RNA reconnaissance motif) de Pfam, si le
La variable d'environnement HMMERDB est définie sur l'emplacement de la base de données Pfam. Le récupéré
Le fichier HMM est écrit au format HMMER 2 ASCII.
La base de données doit avoir un fichier d'index GSI associé. Pour indexer une base de données HMM, utilisez le
Danse hmm2index.
OPTIONS
-h Imprimer une brève aide ; inclut le numéro de version et un résumé de toutes les options, y compris
options d'experts.
-n Interpréter prénom sous forme de numéro HMM au lieu d'un nom. La numérotation commence à 0. Pour
exemple, pour récupérer le premier HMM d'une base de données HMM appelée fou, vous feriez
hmm2fetch -n 0 fou.
Utilisez hmm2fetch en ligne en utilisant les services onworks.net
