Il s'agit de la commande ilink qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
ilink - procédure d'optimisation GEMINI pour trouver une valeur localement optimale du vecteur thêta
des fractions de recombinaison
SYNOPSIS
iLink [Options] fichieriped.dat pedfile.dat
DESCRIPTION
Cette page de manuel documente brièvement les iLink commander. En fait, c'est une intention très brute
de fournir une page de manuel car la distribution Debian GNU/Linux exige que chaque programme
avoir une page de manuel. Toute amélioration serait grandement appréciée.
iLink fait partie de la lien rapide progiciel.
ILINK utilise la procédure d'optimisation GEMINI pour trouver une valeur localement optimale du thêta
vecteur de fractions de recombinaison. Si vous utilisez les scripts par défaut produits par lcp, votre
la supposition initiale pour thêta est de 1 dans chaque dimension. GEMINI évalue chaque thêta par son
probabilité, cherchant à trouver des vecteurs thêta qui ont une probabilité de pedigree plus élevée.
La procédure GEMINI a plusieurs itérations. Chaque itération correspond à une ligne de
sortir. Chaque itération comprend plusieurs évaluations de fonction de vraisemblance. Chaque itération
comporte deux phases. Dans la phase I, GEMINI cherche à améliorer le meilleur thêta actuel. En phase II,
GEMINI estime le gradient de vraisemblance par rapport au meilleur thêta actuel
vecteur. Dans la première itération, la Phase I évalue uniquement la vraisemblance à la première itération
candidat thêta.
Lorsque ILINK imprime une ligne telle que : maxcensor peut être réduit à -32767, c'est terminé
la première évaluation de la fonction de vraisemblance. Sur de longues distances, ce fait peut être utilisé pour estimer
temps de course. Une estimation approximative raisonnable du nombre d'évaluations de fonction est
10*(nombre de dimensions du vecteur thêta). Le nombre de dimensions du vecteur thêta est
un de moins que le nombre de loci dans la plupart des cas. Si maletheta et femaletheta sont autorisés
différer (sexdif est défini sur 1), alors le nombre de dimensions double à 2 * (nombre de
loci - 1). L'estimation d'autres paramètres (avec fitmodel défini sur true) peut également augmenter le
nombre de dimensions.
Pour en apprendre plus sur iLink il peut être utile de lire le fichier
/usr/share/doc/fastlink/LISEZMOI.ILINK si vous avez un système Debian GNU/Linux.
OPTIONS
Il y a peut-être des options mais je n'ai trouvé aucune information à leur sujet. S'il vous plaît, avancez
toute information à leur sujet à[email protected]>
Utilisez ilink en ligne à l'aide des services onworks.net
