Il s'agit de la commande maf2anchors.pl qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
maf2anchors -- Convertit les fichiers maf en ensembles d'ancres Murasaki
SYNOPSIS
maf2ancres
OPTIONS
--préfixe=
utiliser comme préfixe pour les noms de fichiers de sortie (sinon utilise )
--rifts=
permettre jusqu'à des failles.
--fakeseqs
générer de faux fichiers de longueur de séquence et des talons de séquence en fonction des données de longueur de séquence
dans le fichier MAF
--confiance
faites confiance à l'annotation de commentaire ajoutée par TBA sur la deuxième ligne du fichier (si présente)
qu'il répertorie l'arbre utilisé dans l'alignement et toutes les séquences impliquées. Valeurs par défaut
à sur. utilisez --notrust pour ne pas faire confiance aux balises TBA (techniquement, ces données ne font pas partie du
spécification du format de fichier et est juste entassé dans les commentaires que TBA produit, mais
peut ne pas être présent ou précis sur tous les fichiers MAF, nous vous donnons donc la possibilité de
méfiez-vous).
--sorte
Trier les séquences trouvées par --trust (afin de faire correspondre la sortie qui aurait
arrivé avec --notrust).
Utilisez maf2anchors.pl en ligne en utilisant les services onworks.net
