Il s'agit de la commande masai_output_pe qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
masai_output_pe - Sortie Masai - Mode de fin jumelé
SYNOPSIS
masai_output_pe [OPTIONS]
DESCRIPTION
Masai est un mappeur de lecture rapide et précis basé sur des graines approximatives et de multiples
faire marche arrière.
See http://www.seqan.de/projects/masai pour plus d'information.
(c) Copyright 2011-2012 par Enrico Siragusa.
-h, --Aidez-moi
Affiche ce message d'aide.
--version
informations sur la version d'affichage
Options d'appariement :
-ng, --pas d'espace
Ne pas aligner les lectures avec des espaces.
-ll, --bibliothèque-longueur NUM
Longueur de la bibliothèque. Par défaut : 220.
-Le, --erreur-bibliothèque NUM
Tolérance de longueur de bibliothèque. Par défaut : 50.
Options de sortie :
-t, --tmp-dossier STR
Spécifiez un énorme dossier temporaire. Par défaut : utilise le dossier génome.
-o, --fichier de sortie DOSSIER
Spécifiez un fichier de sortie. Par défaut : utilisez le préfixe de nom de fichier reads. Types de fichiers valides
sont : raw et sam.
-NC, --pas de cigare
Ne pas sortir la chaîne CIGAR. Cela n'affecte que la sortie SAM.
Options de débogage :
-nd, --pas de vidage
Ne pas vider les résultats.
VERSION
masai_output_pe version : 0.7.1 [14053] Dernière mise à jour 2013-05-16
Utilisez masai_output_pe en ligne en utilisant les services onworks.net
