mia-2dmyocard-ica - En ligne dans le Cloud

PROGRAMME:

Nom

mia-2dmyocard-ica - Exécuter une analyse ICA sur une série d'images 2D

SYNOPSIS

mia-2dmyocard-ica -i [choix]

DESCRIPTION

mia-2dmyocard-ica Ce programme est utilisé pour exécuter une ICA sur une série de perfusion myocardique
images pour créer des références synthétiques qui peuvent être utilisées pour la correction de mouvement par image
enregistrement. Si l'objectif est d'exécuter une compensation de mouvement complète, il est préférable de créer
un jeu de segmentation et utilisez mia-2dmyoica-nonrigid. Si les données d'entrée sont fournies au moyen d'un
segmentation set, puis on peut également utiliser mia-2dmyocard-icaseries. Ce programme est
essentiellement utilisé pour tester différentes options sur la façon d'exécuter l'image de référence ICA
création.

OPTIONS

-i --in-base=(entrée, requise); io
nom du fichier d'entrée ofolloing pattern nameXXXX.ext X=numbers Pour le fichier pris en charge
types voir PLUGINS:2dimage/io

--coefs=
sortie des coefficients de mélange dans ce fichier

-o --out-base=(sortie); chaîne de caractères
base de nom de fichier de sortie

-t --type=exr
type de fichier de sortie
Appareils valeurs sommes:( @, BMP, MCD, EXR, JPEG, JPG, PNG, CRU,
TIF, TIFF, V, VUE, pb, cmd, exr, JPEG, jpg, png, brut, typhus,
tiff, v, vue, )

-k --skip = 2
sauter les images au début de la série ignorer les images au début de la série

-e --fin=60
dernière image de la sériedernière image de la série

-C --composants=0
nr. de composants, 0=estimation automatiquenr. de composants, 0=estimation
automatiquement

-m --strip-mean
retirer l'image moyenne de la série

-f --save-features=
enregistrer l'image caractéristique

-p --strip-périodique
retirer uniquement le composant périodique

-x --max-ica-itérations=0
itérations max du solveur ICA max itérations du solveur ICA

-n --ica-normaliser
ica_normalize images d'entités

--toutes-fonctionnalités=
enregistrer toutes les images de fonction dans

-L --LV-crop-amp=0
Amplification du masque de recadrage LV, 0.0 = ne pas recadrer Amplification du masque de recadrage LV, 0.0
= ne pas recadrer

-a --auto-composants
estimation automatique du nombre de composants sur la base de la corrélation. Implique
-m et -n (expérimental)

d’aide & Info
-V --verbose=avertissement
verbosité de la sortie, imprimer des messages de niveau donné et de priorités plus élevées.
Les priorités prises en charge à partir du niveau le plus bas sont :
info ‐ Messages de bas niveau
tracer ‐ Trace d'appel de fonction
échouer ‐ Signaler les échecs des tests
avertissement - Mises en garde
erreur - Signaler les erreurs
déboguer ‐ Sortie de débogage
message ‐ Messages normaux
fatal ‐ Ne signaler que les erreurs fatales

--droits d'auteur
imprimer les informations de copyright

-h --aide
imprimer cette aide

- ? --usage
imprimer une courte aide

--version
imprimer le numéro de version et quitter

En cours
--threads = -1
Nombre maximum de threads à utiliser pour le traitement, ce nombre doit être inférieur
ou égal au nombre de cœurs de processeur logique dans la machine. (-1:
estimation automatique).Nombre maximum de threads à utiliser pour le traitement,Ceci
doit être inférieur ou égal au nombre de cœurs de processeur logique dans
la machine. (-1 : estimation automatique).

PLUGINS : image 2D/io

bmp Prise en charge d'entrée/sortie d'images BMP 2D

Extensions de fichiers reconnues : .BMP, .bmp

Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits non signés, 16 bits non signés

pool de données E/S virtuelle vers et depuis le pool de données interne

Extensions de fichiers reconnues : .@

dico io d'image 2D pour DICOM

Extensions de fichiers reconnues : .DCM, .dcm

Types d'éléments pris en charge :
signé 16 bits, non signé 16 bits

exr un plugin 2dimage io pour les images OpenEXR

Extensions de fichiers reconnues : .EXR, .exr

Types d'éléments pris en charge :
32 bits non signé, virgule flottante 32 bits

jpg un plugin 2dimage io pour les images jpeg en niveaux de gris

Extensions de fichiers reconnues : .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Types d'éléments pris en charge :
8 bits non signé

png un plugin 2dimage io pour les images png

Extensions de fichiers reconnues : .PNG, .png

Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits non signés, 16 bits non signés

brut Prise en charge de la sortie d'images RAW 2D

Extensions de fichiers reconnues : .RAW, .raw

Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits signés, 8 bits non signés, 16 bits signés, 16 bits non signés,
signé 32 bits, non signé 32 bits, virgule flottante 32 bits, virgule flottante 64
Bits

tif Prise en charge d'entrée/sortie d'images TIFF 2D

Extensions de fichiers reconnues : .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits non signés, 16 bits non signés, 32 bits non signés

vue un plugin 2dimage io pour les images vista

Extensions de fichiers reconnues : .V, .VISTA, .v, .vista

Types d'éléments pris en charge :
données binaires, 8 bits signés, 8 bits non signés, 16 bits signés, 16 bits non signés,
signé 32 bits, non signé 32 bits, virgule flottante 32 bits, virgule flottante 64
Bits

EXEMPLE

Évaluez les références synthétiques des images imageXXXX.exr et enregistrez-les dans refXXXX.exr
en utilisant cinq composants indépendants, cela signifie supprimer, normaliser et sauter 2 images.

mia-2dmyocard-ica -i imageXXXX.exr -o ref -k 2 -C 5 -m -n

Auteurs)

Gert Wollny

DROIT D'AUTEUR

Ce logiciel est protégé par copyright (c) 1999‐2015 Leipzig, Allemagne et Madrid, Espagne. Ça arrive
avec ABSOLUMENT AUCUNE GARANTIE et vous pouvez le redistribuer selon les termes du GNU
LICENCE PUBLIQUE GENERALE Version 3 (ou ultérieure). Pour plus d'informations, exécutez le programme avec le
l'option '--copyright'.

Utilisez mia-2dmyocard-ica en ligne à l'aide des services onworks.net