Il s'agit de la commande parsinsert qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks à l'aide de l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
ParsInsert - Insertion parcimonie de séquences non classées dans l'arbre phylogénétique
DESCRIPTION
persillage [choix]
Effectuer l'insertion de séquences dans l'arbre donné
-m - lire le masque à partir de ce fichier
-s - lire les séquences de l'arbre de base à partir de ce fichier
(par défaut : PI_Tree.fasta)
-t - lire l'arbre de base à partir de ce fichier
(par défaut : PI_Tree.tree)
-x - lire la taxonomie de l'arbre de base à partir de ce fichier
-o - taxonomie de sortie pour chaque séquence d'insertion dans ce fichier
(par défaut : PI_Results.log)
-l [-| ] - créer un fichier journal (parsInsert.log par défaut)
-n# - nombre de meilleures correspondances à afficher
-c# - seuil de pourcentage en pourcentage
-p - imprimer les commentaires du nœud dans le fichier newick
-D# - affiche les longueurs des branches en utilisant le fichier de séquence d'arbre de # décimales :
PI_Tree.fasta
Utilisez parsinsert en ligne à l'aide des services onworks.net
