pyFAI-recalib - En ligne dans le Cloud

PROGRAMME:

Nom

pyFAI-recalib - Obsolète

DESCRIPTION

utilisation : pyFAI-recalib [options] -i ponifichier -w 1 -c calibrant.D fichier image.edf

Calibrer la géométrie de configuration de diffraction basée sur des images d'anneaux Debye-Sherrer avec a priori
connaissance de votre configuration (un fichier PONI d'entrée). Vous devrez fournir un étalon ou un
Fichier "d-spacing" contenant l'espacement des plans de Miller en Angstrom (par ordre décroissant).
Calibrants disponibles : Ni, CrOx, NaCl, Si_SRM640e, Si_SRM640d, Si_SRM640a, Si_SRM640c,
Si_SRM640b, Cr2O3, AgBh, Si_SRM640, CuO, PBBA, alpha_Al2O3, quartz, C14H30O,
cristobaltite, Si, LaB6, CeO2, LaB6_SRM660a, LaB6_SRM660b, LaB6_SRM660c, TiO2, ZnO, Al, Au
ou recherchez dans la base de données American Mineralogist :
http://rruff.geo.arizona.edu/AMS/amcsd.php Le manuel de formation --calibrateur l'option est obligatoire !

positionnel arguments:
FILE Liste des fichiers à calibrer

facultatif arguments:
-h, --Aidez-moi
afficher ce message d'aide et quitter

-V, --version
afficher le numéro de version du programme et quitter

-o DÉPOSER, --dehors DOSSIER
Nom du fichier où l'image traitée est enregistrée

-v, --verbeux
passer en mode débogage/verbose

-c DÉPOSER, --calibrateur DOSSIER
Nom de l'étalon ou fichier contenant l'espacement d de l'échantillon de référence (OBLIGATOIRE,
sensible aux majuscules et minuscules !)

-w LONGUEUR D'ONDE, --longueur d'onde Longueur d'onde
longueur d'onde du faisceau de rayons X en Angstrom. Obligatoire

-e ÉNERGIE, --énergie ENERGY
énergie du faisceau de rayons X en keV (hc=12.398419292keV.A).

-P POLARISATION_FACTOR, --polarisation POLARISATION_FACTOR
facteur de polarisation, de -1 (vertical) à +1 (horizontal), la valeur par défaut est Aucun (pas
correction), les synchrotrons tournent autour de 0.95

-i DÉPOSER, --poni DOSSIER
fichier contenant le paramètre de diffraction (poni-file). OBLIGATOIRE pour
pyFAI-recalib !

-b CONTEXTE, --Contexte CONTEXTE
Soustraction automatique en arrière-plan si aucune valeur n'est fournie

-d FONCÉ, --foncé DARK
liste d'images sombres séparées par des virgules pour faire la moyenne et soustraire

-f APPARTEMENT, --appartement Ω FLAT
liste d'images plates séparées par des virgules pour faire la moyenne et diviser

-s SPLINE, --spline SPLINE
fichier spline décrivant la distorsion du détecteur

-D DETECTOR_NAME, --détecteur DETECTOR_NAME
Nom du détecteur (au lieu de taille de pixel + spline)

-m MASQUE, --masque MASQUE
fichier contenant le masque (pour la reconstruction de l'image)

-n TNP, --pt NPT
fichier avec les points de données enregistrés. Par défaut : basename.npt

--filtre FILTRE
sélectionnez le filtre, soit moyenne (par défaut), max ou médiane

-l DISTANCE, --distance DISTANCE
distance échantillon-détecteur en millimètre. Par défaut : 100 mm

--dist DISTRIBUTION
distance échantillon-détecteur en mètre. Par défaut : 0.1 m

--poni1 PONI1
coordonnée poni1 en mètre. Par défaut : centre du détecteur

--poni2 PONI2
coordonnée poni2 en mètre. Par défaut : centre du détecteur

--rot1 ROT1
rot1 en radians. par défaut : 0

--rot2 ROT2
rot2 en radians. par défaut : 0

--rot3 ROT3
rot3 en radians. par défaut : 0

--fix-dist
fixer le paramètre de distance

--distribution-libre
libérer le paramètre de distance. Par défaut : activé

--fix-poni1
corriger le paramètre poni1

--gratuit-poni1
libérer le paramètre poni1. Par défaut : activé

--fix-poni2
corriger le paramètre poni2

--gratuit-poni2
libérer le paramètre poni2. Par défaut : activé

--fix-rot1
corriger le paramètre rot1

--free-rot1
libérer le paramètre rot1. Par défaut : activé

--fix-rot2
corriger le paramètre rot2

--free-rot2
libérer le paramètre rot2. Par défaut : activé

--fix-rot3
corriger le paramètre rot3

--free-rot3
libérer le paramètre rot3. Par défaut : activé

--fix-longueur d'onde
fixer le paramètre de longueur d'onde. Par défaut : activé

--longueur d'onde libre
libérer le paramètre de longueur d'onde. Par défaut : désactivé

--inclinaison Permettre dans un premier temps d'affiner l'inclinaison du détecteur (rot1, rot2, rot3). Par défaut : activé

--pas d'inclinaison
Désactiver le raffinement de l'inclinaison et régler toutes les rotations sur 0

--saturation SATURATION
considérer tous les pixels>max*(1-saturation) comme saturés et les reconstruire, valeur par défaut : 0
(désactivé)

--pondéré
le poids correspond à l'intensité, par défaut non.

--npt NPT_1D
Nombre de points dans le motif intégré 1D, Par défaut : 1024

--npt-azim NPT_2D_AZIM
Nombre de secteurs azimutaux dans les images intégrées 2D. Par défaut : 360

--npt-rad NPT_2D_RAD
Nombre de bacs radiaux dans les images intégrées 2D. Par défaut : 400

--unité UNITÉ
Unités valides pour la plage radiale : 2th_deg, 2th_rad, q_nm^-1, q_A^-1, r_mm. Défaut:
2e_degré

--no-gui
forcer le programme à s'exécuter sans interface graphique

--no-interactif
forcer le programme à s'exécuter et à quitter sans demander d'améliorations

-r MAX_RINGS, --anneau MAX_RINGS
nombre maximum d'anneaux à extraire. Par défaut : tous accessibles

-k, --garder
Conserver le point de contrôle existant et en ajouter un nouveau

La principale différence avec pyFAI-calib est la façon dont le point de contrôle d'où les anneaux DebyeSherrer sont
extrait. Tandis que pyFAI-calib repose sur la contiguïté d'une région de pics appelée massif ;
pyFAI-recalib connaît approximativement la géométrie et est capable de sélectionner la région où le
l'anneau devrait être. A partir de cette région, il sélectionne automatiquement les différents pics ; fabrication
pyFAI-recalib capable de fonctionner sans interface graphique et sans intervention humaine
(--no-gui et --non interactif option). Notez que le programme `pyFAI-recalib` est obsolète car
la même fonctionnalité est disponible depuis pyFAI-calib, en utilisant la commande `recalib`
dans le processus de raffinement. Deux options sont disponibles pour recalib : le nombre de sonneries à
extrait (semblable au -r option de ce programme) et une nouvelle option qui vous permet de choisir
entre l'algorithme d'origine "massif" et les plus récents comme "blob" et "watershed"
détection.

Utilisez pyFAI-recalib en ligne en utilisant les services onworks.net