Il s'agit de la commande substitch.pl qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
substitch.pl -- Diviser/fusionner les fichiers de points dans/hors des fichiers de points
SYNOPSIS
substitch.pl --split 5 allchromosomes.stitch # diviser le gros point en 5 à peu près égaux
morceaux
substitch.pl --project allspecies.seqs sub.anchors #projeter des ancres dans un autre
espace de coordonnées (tant que les séquences de composants de point correspondent)
OPTIONS
--verbose => rend plus verbeux --faketfidf => faux scores tfidf basés sur les statistiques de score dans
filet
Remarque sur le fractionnement : Ce programme ne prétend pas produire un fractionnement optimal. Il tente un
couple heuristique, affine les résultats et sélectionne le meilleur arrangement qu'il a trouvé jusqu'à présent.
Techniquement, il s'agit d'une variante du traditionnel « problème d'emballage du coffre », qui est (au
moins dans le cas abstrait) NP-difficile, si je me souviens bien de 15-251. Ce particulier
variété d'emballage de coffre cependant, semble qu'il devrait être résolu plus rapidement (dans le pire des cas, certains
n^k programmation dynamique je pense, mais je parie que cette façon est plus rapide et beaucoup plus facile à
écrire pour 90% des cas là-bas). Si quelqu'un qui lit ceci dit "Espèce d'idiot, cela a
déjà été résolu des milliers de fois", merci de me faire savoir comment : [email protected]
Utilisez substitch.pl en ligne en utilisant les services onworks.net
