Il s'agit de la commande trna2sap qui peut être exécutée dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks en utilisant l'un de nos multiples postes de travail en ligne gratuits tels que Ubuntu Online, Fedora Online, l'émulateur en ligne Windows ou l'émulateur en ligne MAC OS
PROGRAMME:
Nom
trna2sap - convertit la sortie tRNAscan-SE en un objet ASN.1 Seq-annot
SYNOPSIS
trna2sap [-] [-a] [-c str] [-f str] [-i nom de fichier] [-j] [-m str] [-n str] [-o nom de fichier]
[-p dir] [-r dir] [-s] [-t str] [-u] [-x str]
DESCRIPTION
trna2sap lit un fichier texte produit par tRNAscan-SE et produit un ASN.1 Seq- correspondant
annot dans le format compris par d'autres outils NCBI.
OPTIONS
Un résumé des options est inclus ci-dessous.
- Imprimer le message d'utilisation
-a Ajouter une citation tRNAscan-SE
-c str Commentaires
-f str Filtre de sous-chaîne
-i nom de fichier
Fichier d'entrée unique (entrée standard par défaut)
-j Produisez simplement une table de caractéristiques à cinq colonnes, à la trna2tbl (1).
-m str Remarque
-n str Nom d'annotation (normalement « ARNt »).
-o nom de fichier
Fichier de sortie unique (sortie standard par défaut)
-p dir Chemin d'accès aux fichiers
-r dir Chemin des résultats
-s Ignorer les pseudo-ARNt
-t str Titre de l'annotation (normalement « tRNAscan-SE »).
-u Ignorer les ARNt indéterminés
-x str Suffixe de sélection de fichier avec -p (.trna par défaut).
Utilisez trna2sap en ligne en utilisant les services onworks.net
