Il s'agit de l'application Linux nommée Biological Pathway Exchange Language à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom paxtools-5.1.0.jar. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Biological Pathway Exchange Language pour fonctionner sous Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
Biological Pathway Exchange Language à exécuter sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
BioPAX est un langage standard pour l'intégration, l'échange, la visualisation et l'analyse des données des voies biologiques. BioPAX prend en charge l'échange de données entre les groupes de données de voie et réduit ainsi la complexité de l'échange entre les formats de données en fournissant un format standard accepté pour les données de voie. En offrant une norme, avec une sémantique bien définie pour la représentation des voies, BioPAX permet aux bases de données et aux logiciels de voies d'interagir plus efficacement. De plus, BioPAX permet le développement de la visualisation des voies à partir de bases de données et facilite l'analyse des données générées expérimentalement grâce à une combinaison avec des connaissances antérieures. L'effort BioPAX est étroitement coordonné avec celui d'autres initiatives de normes liées aux voies, à savoir ; PSI-MI, SBML, CellML et SBGN afin de fournir une norme compatible dans les domaines où ils se chevauchent.Comment ça marche
- Documentation et exemples BioPAX
- Paxtools (API BioPAX)
- Validateur BioPAX
- Convertisseurs BioPAX
Audience
Science / Recherche
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/biopax/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
