Il s'agit de l'application Linux nommée CBMPy à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom cbmpy-0.7.25.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée CBMPy pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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CBMPy pour fonctionner sous Linux en ligne
DESCRIPTION
PySCeS CBMPy est une nouvelle plateforme de modélisation et d'analyse basée sur les contraintes. Il a été conçu sur la base des principes développés dans le projet de logiciel de simulation PySCeS : convivialité, flexibilité et accessibilité.CBMPy prend en charge les dernières normes d'encodage des modèles CBM, SBML L3 FBC, COBRA ainsi que RDF compatible MIRIAM et les annotations personnalisées.
Son architecture est à la fois extensible et flexible en utilisant des structures de données intuitives pour le biologiste tout en les traduisant de manière transparente dans les structures mathématiques sous-jacentes.
.
CBMPy met en œuvre des analyses courantes telles que FBA, FVA, l'équilibrage élément/charge, l'analyse de réseau et l'édition de modèles ainsi que des méthodes avancées développées pour la modélisation de l'écosystème.
CBMPy prend en charge l'interaction utilisateur via :
- console interactive ou comme bibliothèque pour une utilisation avancée
- GUI, représentation visuelle du modèle, méthodes d'analyse
- une webAPI basée sur SOAP expose des fonctionnalités de haut niveau via des services Web
Features
- prise en charge des normes de modélisation : SBML, SED-ML, SBML3FBC, OMEX (Combine archive)
- prend en charge les annotations conformes à MIRIAM en tant que RDF ainsi que les données de valeurs-clés personnalisées
- plusieurs interfaces utilisateur, GUI CLI, NOUI
- architecture flexible et ouverte
Audience
Science/Recherche, Éducation, Utilisateurs finaux avancés, Utilisateurs finaux/ordinateur de bureau
Interface utilisateur
Console/Terminal, wxWidgets
Langage de programmation
Python
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/cbmpy/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
