Il s'agit de l'application Linux nommée crossmap dont la dernière version peut être téléchargée en tant que v0.6.5.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée crossmap avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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carte croisée
DESCRIPTION
CrossMap est un programme pour la conversion pratique des coordonnées du génome et des fichiers d'annotation du génome entre les assemblages (par exemple, ascenseur de GRCh36/hg18 à GRCh37/hg19 ou vice versa). Il prend en charge les fichiers au format BAM, SAM, BED, Wiggle, BigWig, GFF, GTF .
Fonctionnalités:
- Le génome coordonne la conversion entre les assemblages
- Prise en charge du format d'entrée BAM, SAM, BigWig, Wiggle, BED, VCF
- Fonctionne sous Linux, Mac OS
Audience
Science/Recherche, Éducation, Ingénierie
Langage de programmation
Python, C
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/crossmap/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.