Il s'agit de l'application Linux Just_Preprocess_My_Reads, dont la dernière version est téléchargeable sous le nom justpreprocessmyreads_Aug2015c.tar.gz. Elle peut être exécutée en ligne sur l'hébergeur gratuit OnWorks pour postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée Just_Preprocess_My_Reads avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
Just_Preprocess_My_Reads
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DESCRIPTION
Identifie l'ARNr, les contaminants, les résidus de manière standard, etc. Conserve les paires de lectures. Conçu pour les projets haut débit « fire and forget » (téraoctets de données).
Utilise pbzip2, bowtie2, fastx_toolkit, samtools, fastqc, Trimmomatic (facultatif)
Comment ça marche
- prétraitement illumina
- contrôle de contamination
Audience
Science / Recherche
Catégories
Cette application peut également être téléchargée depuis https://sourceforge.net/projects/justpreprocessmyreads/. Elle est hébergée sur OnWorks afin de pouvoir être exécutée en ligne plus facilement depuis l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
