Il s'agit de l'application Linux nommée MANTIS R Package à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom MANTIS_3.3.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée MANTIS R Package pour une exécution gratuite sous Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
Package MANTIS R à exécuter sous Linux en ligne
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DESCRIPTION
Ce référentiel contient la version de code la plus mise à jour de MANTIS, le package R Multi-locus ANTIgenic Simulator.MANTIS est développé et maintenu par le groupe de recherche Evolutionary Ecology of Infectious Disease (EEID) du Department of Zoology, University of Oxford, UK.
Pour des informations théoriques, veuillez vous référer à « MANTIS : un package R qui simule des modèles multilocus d'évolution des agents pathogènes » (https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-015-0598-9 ACCÈS OUVERT)
Pour le moment, MANTIS n'est pas disponible sur CRAN.
Pour construire un package source de MANTIS, utilisez le script buildPackage.R
Pour installer MANTIS, utilisez 'install.packages(file.tar.gz,type="src",repo=NULL)'
Pour tester, utilisez test_V3.3_code.R
Contactez l'auteur principal de la publication ci-dessus pour plus de détails.
Amusez-vous!
Audience
Science/Recherche, Éducation
Langage de programmation
B / R
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/mantis-r-package/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
