Il s'agit de l'application Linux nommée MDA à exécuter sous Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom mdaGui.zip. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée MDA pour fonctionner sous Linux en ligne avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN
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MDA pour fonctionner sous Linux en ligne
DESCRIPTION
MDA est un logiciel de suivi de particules uniques en 3D qui traite explicitement des expériences de microscopie à fluorescence en profondeur dans des spécimens vivants. Il est capable de minimiser l'erreur systématique qui se produit avec les techniques 3D basées sur l'astigmatisme en raison des aberrations induites par le décalage d'indice de réfraction. Contrairement aux techniques existantes, la méthode détermine l'aberration directement à partir du flux d'images 2D acquis en exploitant le mouvement inhérent des particules et la redondance introduite par l'astigmatisme. Il ne nécessite pas d'effort expérimental supplémentaire pour l'utilisateur et l'imagerie peut être démarrée directement une fois les régions intéressantesdans l'échantillon ont été identifiés.
MDA est écrit en MATLAB et est livré avec une interface utilisateur graphique. La routine d'ajustement des particules est fournie par une bibliothèque externe écrite en C.
Les résultats peuvent être exportés dans l'espace de travail Matlab ou les coordonnées trackID, frameID et xyz sont enregistrées dans des fichiers.
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/mdagui/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
