Il s'agit de l'application Linux nommée SpliceGrapher dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom SpliceGrapher-0.2.7.tgz. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée SpliceGrapher avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
SpliceGrapher
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DESCRIPTION
SpliceGrapher prédit des modèles d'épissage alternatifs et produit des graphiques d'épissage qui capturent dans une structure unique les façons dont les exons d'un gène peuvent être assemblés. Il améliore les modèles de gènes en utilisant les preuves du séquençage de nouvelle génération et des alignements EST.Comment ça marche
- prédiction de graphique d'épissure
- prédiction de jonction d'épissage à l'aide de machines à vecteurs de support
- visualisation du graphique d'épissure
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/splicegrapher/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.
